64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1489 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1489  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 190 aa  388  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023318  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0726  SH3 type 3 domain protein  31.47 
 
 		 214 aa  87.8  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0499  hypothetical protein  26.85 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3683  SH3 type 3 domain-containing protein  29.06 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3625  SH3 type 3 domain-containing protein  27.4 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000261951  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1715  SH3 domain-containing protein  27.45 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2532  hypothetical protein  27.32 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3497  SH3-like region  27.57 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2044  hypothetical protein  29.11 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.74668  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2333  SH3-like region  25.76 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0682642  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03714  SH3, type 3  28.31 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000284257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0365  hypothetical protein  27.71 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.529008 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0747  SH3 type 3 domain protein  27.47 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.737652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1192  hypothetical protein  24.5 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0933  hypothetical protein  26.86 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1880  SH3 type 3 domain-containing protein  26.79 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10220  SH3 domain-containing protein  26.86 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21503  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4197  hypothetical protein  24.14 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1910  hypothetical protein  24.86 
 
 		 249 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00493464  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1504  SH3-like region  24.32 
 
 		 224 aa  51.2  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015461  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0851  SH3 domain-containing protein  28.57 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3097  SH3 type 3 domain-containing protein  29.13 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4292  putative signal transduction protein  30 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000541961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3121  SH3 domain-containing protein  27.98 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.278206 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0567  SH3 type 3 domain-containing protein  24.08 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0820  SH3 type 3 domain-containing protein  28.07 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3772  hypothetical protein  31.36 
 
 		 182 aa  48.5  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3098  SH3 type 3 domain-containing protein  27.11 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000537469  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3845  SH3 domain-containing protein  30.64 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000383374  hitchhiker  0.0000000226441 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0797  putative signal transduction protein  25 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3852  SH3, type 3  23.47 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000664747  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2369  SH3 type 3 domain-containing protein  22.91 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0905  SH3 type 3 domain protein  28.46 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000893023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0881  SH3 type 3 domain-containing protein  28.46 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001426  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.93 
 
 		 476 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3631  hypothetical protein  23.47 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0330275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0915  SH3 type 3 domain-containing protein  25.15 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000529775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2285  SH3 type 3 domain-containing protein  24.21 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150232  normal  0.248949 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0831  putative signal transduction protein  27.91 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2102  SH3 type 3 domain-containing protein  23.47 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.106073  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0447  protein of unknown function DUF1058  27.13 
 
 		 167 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0179  SH3 type 3 domain-containing protein  24.68 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3489  SH3 type 3 domain-containing protein  26.79 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000200384  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3389  putative signal transduction protein  22.66 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3393  putative signal transduction protein  22.66 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3457  putative signal transduction protein  22.66 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.262114 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3463  putative signal transduction protein  22.66 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3559  putative signal transduction protein  22.66 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.617319  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0715  SH3 type 3 domain-containing protein  29.38 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000965232  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.36 
 
 		 1284 aa  44.7  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3457  SH3 type 3 domain-containing protein  27.64 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000152698  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0561  putative signal transduction protein  28.46 
 
 		 206 aa  44.7  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117264  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0642  putative signal transduction protein  28.46 
 
 		 206 aa  44.7  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000817142  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2683  hypothetical protein  26.77 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0191282  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0295  putative signal transduction protein  28.46 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.023009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0690  SH3, type 3  23.98 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000176512  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2347  hypothetical protein  25 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443383 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  25.24 
 
 		 235 aa  42.4  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  32.81 
 
 		 190 aa  42  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  32.31 
 
 		 245 aa  42  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0616  SH3 domain-containing protein  24.56 
 
 		 182 aa  42  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  34.38 
 
 		 578 aa  41.6  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  26.09 
 
 		 185 aa  41.6  0.008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0463  protein of unknown function DUF1058  25.58 
 
 		 167 aa  41.2  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.127072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>