64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1894 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  100 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  54.81 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  53.14 
 
 		 212 aa  204  8e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  50.93 
 
 		 214 aa  202  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  47.09 
 
 		 206 aa  194  9e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  51.22 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  48.54 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  41.95 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  40.98 
 
 		 204 aa  158  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  35.55 
 
 		 199 aa  131  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.06 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  34.45 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  34.45 
 
 		 190 aa  121  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  45.39 
 
 		 140 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  35.24 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  36.1 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  36.19 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  35.71 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  35.58 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  35.58 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.62 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  33.33 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  31.08 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  34.93 
 
 		 193 aa  107  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  34.78 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  34.62 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  33.97 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  35.38 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  30.39 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  32.06 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.81 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  28.16 
 
 		 200 aa  92.4  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  30.66 
 
 		 189 aa  91.7  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  29.13 
 
 		 200 aa  88.2  9e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  32.82 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  27.5 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  31.73 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  25.25 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  35.85 
 
 		 114 aa  77.8  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  44.44 
 
 		 119 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  26.15 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  44.44 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  29.17 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  42.06 
 
 		 117 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  27.05 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  38.74 
 
 		 118 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  25.6 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  25.12 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  24.64 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  47.92 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  42.31 
 
 		 70 aa  51.2  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  42.86 
 
 		 71 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  32.81 
 
 		 70 aa  48.5  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  35.94 
 
 		 70 aa  48.5  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  39.71 
 
 		 73 aa  47.4  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  40 
 
 		 71 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  36.07 
 
 		 72 aa  46.6  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  32.81 
 
 		 70 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  39.22 
 
 		 76 aa  45.1  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  39.22 
 
 		 69 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  31.25 
 
 		 70 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 69 aa  43.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  31.25 
 
 		 70 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>