More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0042 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  100 
 
 
424 aa  877    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  33.97 
 
 
438 aa  225  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.65 
 
 
443 aa  206  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  33.88 
 
 
446 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  31.86 
 
 
445 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  33.03 
 
 
446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  29.83 
 
 
447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  30.53 
 
 
447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  30.31 
 
 
447 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  33.33 
 
 
434 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  29.59 
 
 
447 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  32.68 
 
 
434 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  33.41 
 
 
443 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  29.9 
 
 
445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  31.56 
 
 
441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  31.54 
 
 
442 aa  173  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  29.23 
 
 
440 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  31.03 
 
 
444 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  31.52 
 
 
443 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  30.68 
 
 
460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
438 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
438 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  29.93 
 
 
445 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  30.86 
 
 
464 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  31.89 
 
 
444 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  29.75 
 
 
489 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.24 
 
 
419 aa  130  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  24.27 
 
 
419 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  23.44 
 
 
419 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.22 
 
 
430 aa  96.7  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  26.84 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  25.91 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.56 
 
 
447 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0492  ferric reductase  23.4 
 
 
435 aa  78.2  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.673317  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.56 
 
 
421 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  24.6 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.6 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  27.65 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.24 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.62 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  29.18 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.23 
 
 
448 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  22.08 
 
 
465 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.27 
 
 
465 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  33.96 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  26.21 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4160  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27 
 
 
962 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.312376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  30.54 
 
 
450 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.83 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.32 
 
 
494 aa  67.4  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29 
 
 
453 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25.52 
 
 
371 aa  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.37 
 
 
368 aa  63.9  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.62 
 
 
232 aa  63.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7048  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  26.69 
 
 
340 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0913  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit BenC  25.99 
 
 
339 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  27.57 
 
 
355 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1405  oxidoreductase FAD-binding subunit  23.71 
 
 
881 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2603  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.2 
 
 
286 aa  61.6  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1299  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.29 
 
 
928 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0627  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.12 
 
 
270 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000059067  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  25 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.41 
 
 
254 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4405  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  27.84 
 
 
339 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1567  hydrogenase/sulfur reductase, gamma subunit  26.86 
 
 
274 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  30.41 
 
 
395 aa  60.1  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  24.6 
 
 
376 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  24.6 
 
 
376 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.16 
 
 
344 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0901  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.9 
 
 
261 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0882  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.29 
 
 
283 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.256079 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2095  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.69 
 
 
274 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6133  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.29 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.4 
 
 
340 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324243  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1389  oxidoreductase FAD-binding subunit  23.28 
 
 
881 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0387303  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1304  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.29 
 
 
340 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1371  oxidoreductase FAD-binding region  23.28 
 
 
881 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1196  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.96 
 
 
288 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6526  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.29 
 
 
340 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5350  oxidoreductase FAD-binding subunit  22.91 
 
 
340 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.213773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.23 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1280  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.96 
 
 
262 aa  58.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  24.04 
 
 
394 aa  57.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  27.52 
 
 
364 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4862  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.17 
 
 
354 aa  57.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350242  normal  0.072998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1051  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.7 
 
 
337 aa  57.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.328018 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  29.01 
 
 
362 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2780  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  21.89 
 
 
336 aa  57.4  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963847  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2019  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  23.81 
 
 
393 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  33.33 
 
 
232 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1256  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.64 
 
 
275 aa  57  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  37.84 
 
 
1148 aa  57  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1464  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  31.82 
 
 
299 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6582  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.9 
 
 
341 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10458  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4884  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer component  25.55 
 
 
339 aa  56.6  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.217527  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.79 
 
 
305 aa  56.6  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.44 
 
 
372 aa  56.6  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2588  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.21 
 
 
287 aa  56.6  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.28 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>