More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3150 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 640 aa  1306    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3612  cobalamin synthesis protein, P47K  46.86 
 
 		 624 aa  527  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  36.63 
 
 		 614 aa  364  3e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  34.35 
 
 		 596 aa  340  5.9999999999999996e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  34.55 
 
 		 625 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0508  cobalamin synthesis protein, P47K  34.04 
 
 		 648 aa  324  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1723  cobalamin synthesis protein P47K  26.18 
 
 		 615 aa  188  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  32.42 
 
 		 349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  31.8 
 
 		 341 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  31.99 
 
 		 346 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  31.13 
 
 		 327 aa  141  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  31.87 
 
 		 349 aa  140  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  29.72 
 
 		 379 aa  140  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  29.3 
 
 		 308 aa  139  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  29.72 
 
 		 372 aa  139  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  35.02 
 
 		 332 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  32.2 
 
 		 346 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  30.34 
 
 		 384 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  31.33 
 
 		 366 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  31.13 
 
 		 364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  32.15 
 
 		 343 aa  133  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  30.75 
 
 		 353 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  31.29 
 
 		 323 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0193  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 		 320 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.9456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  29.32 
 
 		 338 aa  131  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  31.5 
 
 		 323 aa  131  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  31.35 
 
 		 320 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  31.78 
 
 		 320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  30.03 
 
 		 298 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  30.84 
 
 		 394 aa  130  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  28.4 
 
 		 342 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  30.14 
 
 		 380 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  29.79 
 
 		 373 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  30.41 
 
 		 313 aa  128  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  33.57 
 
 		 335 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  28.62 
 
 		 344 aa  127  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  31.41 
 
 		 323 aa  127  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  30.96 
 
 		 323 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  29.75 
 
 		 362 aa  126  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6702  putative cobalamin synthesis protein cobW  30.26 
 
 		 309 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203286  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  29.97 
 
 		 364 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  31.48 
 
 		 322 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  32.04 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  32.85 
 
 		 329 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  31.62 
 
 		 328 aa  125  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  31.62 
 
 		 328 aa  125  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  29.72 
 
 		 364 aa  124  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  29.58 
 
 		 360 aa  124  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  28.98 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  33.95 
 
 		 324 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  30.03 
 
 		 339 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  28.53 
 
 		 378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  29.96 
 
 		 336 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0727  cobalamin synthesis protein P47K  28.62 
 
 		 308 aa  122  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  29.91 
 
 		 311 aa  122  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  28.66 
 
 		 307 aa  122  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0711  cobalamin synthesis protein, P47K  28.62 
 
 		 308 aa  122  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  30.39 
 
 		 341 aa  121  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 		 320 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  34.03 
 
 		 334 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  39.9 
 
 		 369 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  27.68 
 
 		 357 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  27.49 
 
 		 328 aa  120  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.43 
 
 		 307 aa  120  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  37.84 
 
 		 457 aa  120  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  32.03 
 
 		 328 aa  120  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  37.14 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.32 
 
 		 320 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  36.27 
 
 		 379 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.32 
 
 		 307 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.32 
 
 		 307 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.12 
 
 		 307 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  26.87 
 
 		 293 aa  118  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  30.04 
 
 		 323 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5244  hypothetical protein  32.64 
 
 		 334 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536165  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.04 
 
 		 323 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  29.28 
 
 		 343 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  40.8 
 
 		 382 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2604  cobalamin synthesis protein, P47K  26.19 
 
 		 296 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2658  cobalamin synthesis protein P47K  26.19 
 
 		 296 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  38.89 
 
 		 393 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  28.84 
 
 		 349 aa  117  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  37.64 
 
 		 324 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.04 
 
 		 305 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.76 
 
 		 374 aa  117  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.19 
 
 		 318 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  32.25 
 
 		 326 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  30.12 
 
 		 344 aa  117  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  34.87 
 
 		 452 aa  117  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  34.87 
 
 		 449 aa  117  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  28.93 
 
 		 367 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0344  cobalamin synthesis/P47K family protein  26.16 
 
 		 308 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  28.39 
 
 		 358 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  33.68 
 
 		 362 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  33.68 
 
 		 362 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  34.87 
 
 		 449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  34.87 
 
 		 449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.09 
 
 		 386 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  38.59 
 
 		 364 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  37.5 
 
 		 363 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>