More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0024 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 208 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  50.27 
 
 		 206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  44.5 
 
 		 203 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  42.18 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  42.18 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  42.18 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  42.18 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  42.18 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  42.18 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  43.41 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  43.41 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  43.41 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  43.41 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  41.71 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  41.35 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.71 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  44.93 
 
 		 206 aa  152  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  39.44 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.28 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  42.72 
 
 		 204 aa  148  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  42.72 
 
 		 204 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  38.92 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  43.66 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  41.78 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  40.19 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  40.57 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  40.76 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  40.57 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.7 
 
 		 204 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  44.22 
 
 		 213 aa  141  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  41.95 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  41.95 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  41.95 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  40.49 
 
 		 204 aa  141  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  41.95 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 204 aa  141  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  38.97 
 
 		 217 aa  141  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 		 208 aa  141  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  40.19 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  40.19 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  40.19 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.46 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  40.76 
 
 		 211 aa  138  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0311  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.59 
 
 		 214 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.32 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  40.19 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.25 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.35 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  40.49 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.41 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  41.23 
 
 		 210 aa  134  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.12 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  39.61 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.38 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  40.76 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  35.58 
 
 		 204 aa  131  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  39.91 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  39.91 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  39.44 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  39.91 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  36.68 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  39.91 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  40.76 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  39.78 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  41.09 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  41.09 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  41.09 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.04 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  40.62 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  40.62 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  40.62 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  35.64 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.17 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  38.43 
 
 		 205 aa  124  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  36.26 
 
 		 202 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  42.54 
 
 		 206 aa  124  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.8 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  40.89 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  42.13 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  42.13 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1808  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.702237  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.62 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  41.4 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  35.19 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  39.02 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 242 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  42.77 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  42.77 
 
 		 207 aa  121  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  35.18 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  35.15 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.33 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>