More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1603 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 392 aa  798    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  69.39 
 
 		 392 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  67.18 
 
 		 391 aa  558  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  67.27 
 
 		 390 aa  536  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  58.27 
 
 		 389 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  57.94 
 
 		 388 aa  471  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  57.74 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  56.84 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  57.03 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  56.07 
 
 		 390 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  58.2 
 
 		 382 aa  461  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  57.63 
 
 		 382 aa  463  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  56.32 
 
 		 382 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  56.99 
 
 		 382 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  54.29 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.83 
 
 		 385 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  56.51 
 
 		 389 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.12 
 
 		 387 aa  434  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  55.35 
 
 		 388 aa  431  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  50.53 
 
 		 386 aa  428  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  54.55 
 
 		 384 aa  429  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.65 
 
 		 385 aa  426  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.74 
 
 		 388 aa  418  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.37 
 
 		 390 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  49.6 
 
 		 402 aa  406  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  55.12 
 
 		 387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  48.84 
 
 		 403 aa  401  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.56 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  49.61 
 
 		 389 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  47.49 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  47.23 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  48.28 
 
 		 391 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  47.23 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  47.23 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  45.43 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  44.27 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  47.66 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  46.07 
 
 		 390 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  45.71 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  43.93 
 
 		 393 aa  363  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  48.83 
 
 		 395 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  44.22 
 
 		 395 aa  362  7.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  42.38 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  42.56 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  46.01 
 
 		 389 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  43.08 
 
 		 394 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  44.95 
 
 		 392 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  43.52 
 
 		 399 aa  353  4e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  44.09 
 
 		 409 aa  352  5e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  45.17 
 
 		 413 aa  349  4e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  43.56 
 
 		 394 aa  349  6e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  43.98 
 
 		 392 aa  348  8e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  45.45 
 
 		 393 aa  348  1e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  43.83 
 
 		 392 aa  347  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  43.86 
 
 		 393 aa  346  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  41.79 
 
 		 421 aa  346  4e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  44.3 
 
 		 425 aa  346  5e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  43.31 
 
 		 406 aa  346  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  43.64 
 
 		 400 aa  346  5e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  42.78 
 
 		 396 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  42.86 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  42.6 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  41.78 
 
 		 391 aa  343  4e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  43.41 
 
 		 403 aa  343  4e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  43.19 
 
 		 392 aa  342  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  42.78 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  42.78 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  42.78 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  42.78 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  42.78 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  43.83 
 
 		 393 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  43.83 
 
 		 393 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  43.81 
 
 		 407 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  43.31 
 
 		 392 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  41.45 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1823  aminotransferase  43.3 
 
 		 407 aa  335  7e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  41.71 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  40.99 
 
 		 411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  41.6 
 
 		 407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  41.58 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  41.25 
 
 		 411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  43.19 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  41.34 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  41.78 
 
 		 406 aa  327  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  41.78 
 
 		 406 aa  327  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  41.25 
 
 		 412 aa  326  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  40.47 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  41.32 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  43.19 
 
 		 394 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  41.05 
 
 		 402 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  40.99 
 
 		 407 aa  325  7e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  41.86 
 
 		 405 aa  325  7e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  41.78 
 
 		 411 aa  325  7e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  41.13 
 
 		 409 aa  325  9e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  40.79 
 
 		 413 aa  324  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  40.73 
 
 		 412 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  40.73 
 
 		 412 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  40.99 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  40.99 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  41.51 
 
 		 411 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>