34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2470 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2470  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.774502  normal  0.494629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2827  3'-5' exonuclease  44.21 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0393048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2737  3'-5' exonuclease  40.31 
 
 		 198 aa  148  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2621  3'-5' exonuclease  41.58 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1397  3'-5' exonuclease  41.76 
 
 		 195 aa  144  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937954  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1697  3'-5' exonuclease  42.71 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4830  3'-5' exonuclease  47.47 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0991293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3433  3'-5' exonuclease  39.89 
 
 		 292 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2388  3'-5' exonuclease  34.22 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000109184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0888  3'-5' exonuclease  35.71 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329161  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0883  3'-5' exonuclease  34.95 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0280341 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1912  3'-5' exonuclease  35.48 
 
 		 202 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254298  normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3387  3'-5' exonuclease  36.36 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3512  3'-5' exonuclease  35.66 
 
 		 315 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643646  normal  0.0140367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2929  3'-5' exonuclease  36.42 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00209751  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0365  3'-5' exonuclease domain-containing protein  33.12 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1964  3'-5' exonuclease  30.61 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3291  3'-5' exonuclease  34.97 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000349721  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1014  3'-5' exonuclease  35.37 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1066  3'-5' exonuclease  35.67 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0869717  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0976  3'-5' exonuclease  35.37 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0707907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1153  exonuclease, putative  36.2 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0980  3'-5' exonuclease  34.48 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  29.71 
 
 		 925 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  29.71 
 
 		 925 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27893  predicted protein  33.77 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.70309 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05310  hypothetical protein  30.32 
 
 		 912 aa  52  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  30 
 
 		 894 aa  48.9  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93442  predicted protein  27.5 
 
 		 389 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  26.51 
 
 		 382 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  30.06 
 
 		 583 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1349  DNA-directed DNA polymerase  32.26 
 
 		 682 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.201208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1610  3'-5' exonuclease  29.24 
 
 		 383 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533574  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  25.73 
 
 		 382 aa  42.4  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>