More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5521 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5521  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
374 aa  756    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284682  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1031  histidinol-phosphate aminotransferase  71.51 
 
 
370 aa  519  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0729  histidinol-phosphate aminotransferase  68.73 
 
 
368 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0762  histidinol-phosphate aminotransferase  69.27 
 
 
368 aa  489  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.865966  normal  0.0190089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4374  histidinol-phosphate aminotransferase  67.03 
 
 
396 aa  478  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279737  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  65.73 
 
 
371 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  63.64 
 
 
363 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  63.79 
 
 
365 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  61.43 
 
 
369 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  63.25 
 
 
375 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  61.23 
 
 
358 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  54.52 
 
 
366 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  54.52 
 
 
366 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  55.62 
 
 
356 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  54.78 
 
 
356 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  54.49 
 
 
356 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  55.12 
 
 
374 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  53.64 
 
 
374 aa  347  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  54.6 
 
 
357 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  53.46 
 
 
374 aa  345  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  54.6 
 
 
364 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  53.45 
 
 
357 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  55.17 
 
 
357 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  55.17 
 
 
357 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  55.17 
 
 
357 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  52.87 
 
 
356 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  52.87 
 
 
356 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  52.87 
 
 
356 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  52.87 
 
 
356 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  52.87 
 
 
356 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  52.59 
 
 
356 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  52.59 
 
 
356 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  52.59 
 
 
356 aa  332  6e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  54.02 
 
 
357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  46.7 
 
 
363 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  43.09 
 
 
368 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  43.77 
 
 
365 aa  272  9e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  45.15 
 
 
365 aa  271  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  44.69 
 
 
360 aa  268  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  40.54 
 
 
365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  43.06 
 
 
359 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  43.06 
 
 
359 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  38.99 
 
 
363 aa  190  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  38.96 
 
 
369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.41 
 
 
351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  31.04 
 
 
349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  29.95 
 
 
351 aa  181  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  32.88 
 
 
360 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  31.83 
 
 
349 aa  179  5.999999999999999e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
355 aa  176  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  30.33 
 
 
356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  32.16 
 
 
348 aa  172  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  30.11 
 
 
358 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  34.48 
 
 
373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  31.75 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  35.01 
 
 
363 aa  160  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  34.69 
 
 
377 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  32.54 
 
 
357 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  32.1 
 
 
355 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  28.05 
 
 
371 aa  157  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  32.49 
 
 
360 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  33.01 
 
 
351 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  30.64 
 
 
352 aa  153  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  34.73 
 
 
374 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 
357 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2341  class I/II aminotransferase  30.99 
 
 
382 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.416124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  32.6 
 
 
364 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  29.33 
 
 
350 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  31.18 
 
 
365 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  34.29 
 
 
365 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4690  histidinol-phosphate aminotransferase  30.26 
 
 
376 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343336  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  32.02 
 
 
363 aa  149  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1477  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
357 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  32.49 
 
 
357 aa  149  9e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  34.32 
 
 
365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  29.82 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2242  histidinol-phosphate aminotransferase  31.2 
 
 
380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  29.64 
 
 
371 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
362 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  34.25 
 
 
360 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  31.81 
 
 
370 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  32.23 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  26.44 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  24.65 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07350  histidinol-phosphate aminotransferase  34.88 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  31.34 
 
 
357 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  28.21 
 
 
364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  31.23 
 
 
369 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  24.34 
 
 
371 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  30.85 
 
 
355 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  29.75 
 
 
368 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  24.54 
 
 
371 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  34.34 
 
 
361 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1059  histidinol-phosphate aminotransferase  35.1 
 
 
406 aa  138  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0743444  normal  0.133143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1917  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 
453 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0201149  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  30.54 
 
 
350 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  31.2 
 
 
357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  28.81 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  34 
 
 
370 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2393  histidinol-phosphate aminotransferase  34.93 
 
 
375 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  0.464709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>