189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3761 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3761  carbohydrate kinase  100 
 
 		 195 aa  398  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117774  decreased coverage  0.00501521 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2053  carbohydrate kinase  70.19 
 
 		 182 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402003  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1876  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  70.19 
 
 		 182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.616409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2797  gluconate kinase  63.47 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.654483  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1235  carbohydrate kinase  58.02 
 
 		 189 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5548  carbohydrate kinase  55.56 
 
 		 180 aa  168  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2939  gluconokinase  54.6 
 
 		 173 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3028  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54.32 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34640  gluconokinase  53.99 
 
 		 173 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.425531  normal  0.105648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27310  gluconokinase  57.72 
 
 		 175 aa  157  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2785  carbohydrate kinase  53.09 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3337  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  52.38 
 
 		 175 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00678717 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  51.25 
 
 		 178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3416  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.85 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0373306  normal  0.327266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3564  gluconokinase  53.8 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00350968  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2346  carbohydrate kinase  51.85 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2524  carbohydrate kinase  51.23 
 
 		 179 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2569  carbohydrate kinase  51.55 
 
 		 373 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00777638  hitchhiker  0.0000000380765 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22480  gluconokinase  55.7 
 
 		 174 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.99 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.67 
 
 		 178 aa  147  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4336  gluconate kinase  47.85 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  47.13 
 
 		 174 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.27 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.07 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.44 
 
 		 167 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.1 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0956  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  49.43 
 
 		 189 aa  137  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0046  carbohydrate kinase  49.41 
 
 		 169 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.324095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0327  carbohydrate kinase  56.85 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  44.38 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  46.84 
 
 		 184 aa  134  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.1 
 
 		 169 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  42.94 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.86 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.66 
 
 		 182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2070  carbohydrate kinase  47.47 
 
 		 174 aa  131  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280149  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  43.04 
 
 		 169 aa  130  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2356  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.45 
 
 		 182 aa  130  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.63212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  46.2 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  46.2 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9123  gluconokinase  47.71 
 
 		 171 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.4 
 
 		 200 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  45.57 
 
 		 178 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0926  gluconate kinase  47.74 
 
 		 202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2936  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  45.16 
 
 		 177 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.300006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45 
 
 		 172 aa  128  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  47.74 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1404  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  41.77 
 
 		 627 aa  125  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.214778  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  40.62 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.25 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  40.62 
 
 		 174 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1046  gluconate kinase  48.28 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000585509  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2408  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.37 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.949742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0595  carbohydrate kinase  42.22 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0904  gluconate kinase  40.49 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.119231  decreased coverage  0.0000000668063 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  39.49 
 
 		 171 aa  122  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  46.88 
 
 		 167 aa  121  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0770  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.76 
 
 		 159 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6828  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.67 
 
 		 207 aa  120  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0983  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.95 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0150853  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.03 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.31 
 
 		 759 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3661  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.5 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  40.74 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2124  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.51 
 
 		 174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0584  carbohydrate kinase  43.62 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170664  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0558  carbohydrate kinase  43.62 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1135  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.36 
 
 		 181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0310526 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  40.62 
 
 		 170 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3644  carbohydrate kinase  43.23 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  42.86 
 
 		 779 aa  118  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  43.67 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3749  gluconate kinase  43.62 
 
 		 167 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2645  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  43.48 
 
 		 172 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1220  thermoresistant gluconokinase  42.5 
 
 		 173 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4770  D-gluconate kinase  44.53 
 
 		 176 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.210509  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  44.38 
 
 		 429 aa  117  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4833  D-gluconate kinase  44.53 
 
 		 176 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4889  D-gluconate kinase  44.53 
 
 		 176 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4740  D-gluconate kinase  44.53 
 
 		 176 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0672986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  46.36 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  43.95 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0180  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  42.95 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  36.59 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0663  carbohydrate kinase  42.95 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4870  D-gluconate kinase  44.53 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0564228 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2720  carbohydrate kinase  43.62 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.29 
 
 		 175 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0630  carbohydrate kinase  42.95 
 
 		 167 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2443  thermoresistant gluconokinase  42.41 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3439  shikimate kinase  42.41 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3770  carbohydrate kinase  44.74 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0359  thermoresistant gluconokinase  42.41 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1217  thermoresistant gluconokinase  42.41 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3403  putative thermoresistant gluconokinase  42.41 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3437  putative thermoresistant gluconokinase  42.41 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2628  thermoresistant gluconokinase  42.41 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0043609  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5299  carbohydrate kinase thermoresistant glucokinase family  48.91 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  42.04 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>