More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0739 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 388 aa  799    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  91.75 
 
 		 388 aa  750    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  92.21 
 
 		 390 aa  747    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  56.14 
 
 		 392 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  55.56 
 
 		 384 aa  455  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  56.58 
 
 		 391 aa  455  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  56.96 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  53 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  53.44 
 
 		 382 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  54.23 
 
 		 382 aa  437  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  51.96 
 
 		 382 aa  434  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  57.94 
 
 		 392 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  51.59 
 
 		 388 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  51.57 
 
 		 382 aa  430  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.26 
 
 		 385 aa  421  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.34 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  51.04 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.21 
 
 		 385 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.65 
 
 		 388 aa  408  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.26 
 
 		 389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.82 
 
 		 387 aa  403  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.83 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  49.48 
 
 		 389 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  50.39 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  47.67 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  47.79 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  49.09 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  45.24 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  44.76 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  45.5 
 
 		 403 aa  363  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  45.24 
 
 		 392 aa  359  6e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  44.44 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  44.62 
 
 		 388 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  46.03 
 
 		 389 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  43.12 
 
 		 392 aa  355  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  42.74 
 
 		 390 aa  354  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  43.57 
 
 		 391 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  42.16 
 
 		 393 aa  352  8e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  42.64 
 
 		 391 aa  351  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  43.57 
 
 		 394 aa  348  8e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  42.29 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  43.41 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  40.36 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  43.52 
 
 		 425 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  43.31 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  42.49 
 
 		 393 aa  346  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  45.03 
 
 		 395 aa  345  6e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  42.64 
 
 		 409 aa  345  7e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  41.19 
 
 		 395 aa  345  7e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  44.53 
 
 		 392 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  44.53 
 
 		 392 aa  342  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  44.53 
 
 		 392 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  44.27 
 
 		 406 aa  342  8e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  44.53 
 
 		 392 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  44.18 
 
 		 392 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  44.27 
 
 		 392 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  43.38 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  44.01 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  44.27 
 
 		 392 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  40.57 
 
 		 394 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  43.84 
 
 		 399 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0159  succinyldiaminopimelate transaminase  42.43 
 
 		 407 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.899498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  43.24 
 
 		 393 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  43.24 
 
 		 393 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  43.65 
 
 		 392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3016  aminotransferase  42.23 
 
 		 406 aa  335  5.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562115  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  42.2 
 
 		 405 aa  335  7.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  42.2 
 
 		 405 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3869  succinyldiaminopimelate transaminase  42.67 
 
 		 392 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  43.04 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  41.36 
 
 		 403 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  40.47 
 
 		 396 aa  332  7.000000000000001e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  41.73 
 
 		 400 aa  331  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0944  succinyldiaminopimelate transaminase  41.6 
 
 		 390 aa  331  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.989177  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  39.59 
 
 		 421 aa  331  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  41.93 
 
 		 406 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  41.93 
 
 		 406 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  40.66 
 
 		 405 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1738  aminotransferase  41.94 
 
 		 405 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.990718  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  42.26 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1823  aminotransferase  43.88 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  42.42 
 
 		 390 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  41.18 
 
 		 405 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3918  succinyldiaminopimelate transaminase  41.65 
 
 		 392 aa  329  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000686397  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  41.41 
 
 		 407 aa  328  8e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  41.73 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  41.73 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1794  succinyldiaminopimelate transaminase  40.36 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.455812  decreased coverage  0.0036927 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  42.02 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  41.47 
 
 		 399 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  41.47 
 
 		 399 aa  325  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  41.47 
 
 		 399 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  41.42 
 
 		 397 aa  325  9e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  41.21 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  40.93 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  41.34 
 
 		 394 aa  324  1e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  41.99 
 
 		 392 aa  324  1e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  41.21 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  41.21 
 
 		 399 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  41.47 
 
 		 399 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>