More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3514 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  57.22 
 
 		 186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  207  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 184 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  204  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 182 aa  202  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1252  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.538826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  51.32 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  197  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  197  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  197  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  197  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  197  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 186 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 184 aa  194  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  194  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  50.87 
 
 		 173 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  45.11 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 174 aa  191  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 184 aa  191  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 184 aa  190  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  190  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 182 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1273  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235676  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01376  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0186665  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 182 aa  187  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1370  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102814  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 181 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  49.14 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 182 aa  186  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0407  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00332415  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05771  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  46.24 
 
 		 173 aa  185  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0521  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 184 aa  185  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06770  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000531316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1486  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>