More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2798 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  251  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  65.32 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  65.32 
 
 		 126 aa  166  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  59.2 
 
 		 126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  62.5 
 
 		 124 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  62.5 
 
 		 124 aa  157  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  59.84 
 
 		 125 aa  157  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  58.68 
 
 		 143 aa  156  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 125 aa  155  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  60.66 
 
 		 125 aa  154  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  59.68 
 
 		 124 aa  154  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  57.85 
 
 		 124 aa  154  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  58.68 
 
 		 128 aa  152  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 125 aa  151  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  59.35 
 
 		 124 aa  151  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  59.5 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  59.5 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 126 aa  150  7e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  56.45 
 
 		 127 aa  150  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  58.2 
 
 		 126 aa  150  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  58.2 
 
 		 126 aa  150  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  59.68 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 124 aa  148  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  60.66 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  57.72 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  57.72 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  55 
 
 		 129 aa  146  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 124 aa  146  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 129 aa  146  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 129 aa  146  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 125 aa  145  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  59.66 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 126 aa  145  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  56.91 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  53.28 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 124 aa  144  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  56.69 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 124 aa  143  9e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 128 aa  143  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 129 aa  141  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  57.98 
 
 		 122 aa  141  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  55.28 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  54.33 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  55.91 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  53.33 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  141  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  53.28 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 136 aa  140  6e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  52.46 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 		 128 aa  140  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  51.64 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  52.89 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  52.89 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  51.67 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 126 aa  137  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 125 aa  138  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  52.34 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  52.76 
 
 		 129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  50.4 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  53.54 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  50 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 129 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 128 aa  137  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  50.41 
 
 		 148 aa  137  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  52.07 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>