More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2697 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  100 
 
 		 391 aa  795    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  73.52 
 
 		 389 aa  616  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  50 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  50.52 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  51.04 
 
 		 390 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  51.09 
 
 		 373 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  50.95 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  50.14 
 
 		 373 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  50.54 
 
 		 373 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  50.27 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  50.54 
 
 		 373 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  50.27 
 
 		 380 aa  383  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  46.17 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  48.25 
 
 		 377 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  49.08 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  50.93 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  46.93 
 
 		 371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  47.34 
 
 		 379 aa  352  8.999999999999999e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  45.48 
 
 		 390 aa  348  6e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  45.11 
 
 		 369 aa  348  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  45.36 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  46.49 
 
 		 380 aa  333  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  43.48 
 
 		 391 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  43.22 
 
 		 391 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  43.48 
 
 		 391 aa  333  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  43.22 
 
 		 391 aa  332  6e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  43.85 
 
 		 392 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  42.97 
 
 		 391 aa  328  7e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  42.97 
 
 		 391 aa  328  7e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  42.71 
 
 		 391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  43.22 
 
 		 391 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  42.97 
 
 		 391 aa  325  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  43.73 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  44.24 
 
 		 380 aa  310  4e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  44.75 
 
 		 851 aa  309  6.999999999999999e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  43.27 
 
 		 398 aa  308  8e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  43.46 
 
 		 433 aa  296  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  40.38 
 
 		 370 aa  295  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  43.54 
 
 		 380 aa  290  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  42.13 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  43.24 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  39.78 
 
 		 395 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  41.51 
 
 		 379 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  39.53 
 
 		 384 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  40.33 
 
 		 375 aa  282  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  39.78 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  38.98 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  42.32 
 
 		 382 aa  280  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  38.34 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  43.72 
 
 		 811 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  40.46 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  40.46 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  39.79 
 
 		 393 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  40.72 
 
 		 389 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  40.21 
 
 		 389 aa  276  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  41.67 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  40.21 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  40.21 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  40.21 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  40.21 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  40.21 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  39.95 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  37.27 
 
 		 395 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  39.95 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  40.58 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  38.13 
 
 		 441 aa  266  4e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  38.24 
 
 		 403 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  38.34 
 
 		 395 aa  266  5e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  39.14 
 
 		 395 aa  266  5e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  38.5 
 
 		 376 aa  266  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  38.3 
 
 		 403 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  38.83 
 
 		 374 aa  265  8e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  37.43 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  38.83 
 
 		 375 aa  263  6e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  37.57 
 
 		 434 aa  261  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  37.6 
 
 		 421 aa  260  2e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  38.69 
 
 		 375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  38.61 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  36.77 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  43.9 
 
 		 849 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  38.61 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  37.16 
 
 		 378 aa  252  8.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  43.63 
 
 		 844 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  39.37 
 
 		 373 aa  249  5e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  36.29 
 
 		 374 aa  249  7e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  35.85 
 
 		 406 aa  248  9e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  37.84 
 
 		 365 aa  248  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  35.09 
 
 		 397 aa  246  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  34.1 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  40.59 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  38.54 
 
 		 372 aa  242  7.999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  36.58 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  36.15 
 
 		 411 aa  239  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  36.83 
 
 		 383 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  36.83 
 
 		 383 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  37.84 
 
 		 408 aa  238  9e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  36.83 
 
 		 383 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  35.33 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  35.77 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  37.77 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>