More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1321 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
386 aa  784    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  70.31 
 
 
379 aa  552  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  59.54 
 
 
388 aa  434  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  55.78 
 
 
375 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  56.1 
 
 
382 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  56.96 
 
 
377 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  59.22 
 
 
386 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  54.71 
 
 
379 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  55.73 
 
 
373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  57.03 
 
 
382 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  53.11 
 
 
381 aa  401  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  57.18 
 
 
380 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  51.93 
 
 
370 aa  398  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  50.91 
 
 
373 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  52.76 
 
 
374 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  53.81 
 
 
376 aa  388  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
376 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  54.22 
 
 
388 aa  385  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  50.26 
 
 
370 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  55.14 
 
 
387 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  53.14 
 
 
374 aa  381  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  55.14 
 
 
387 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  54.57 
 
 
380 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  53.09 
 
 
377 aa  375  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  52.04 
 
 
381 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  53.25 
 
 
372 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  48.95 
 
 
377 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  55.12 
 
 
372 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  49.23 
 
 
374 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  51.18 
 
 
377 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  53.51 
 
 
373 aa  362  6e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  48.35 
 
 
386 aa  362  6e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  48.72 
 
 
374 aa  362  8e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  51.17 
 
 
372 aa  362  9e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  50.66 
 
 
375 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  51.97 
 
 
366 aa  360  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  50.91 
 
 
373 aa  360  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  49.22 
 
 
388 aa  360  3e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  53.06 
 
 
379 aa  359  4e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  48.83 
 
 
371 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 
381 aa  359  4e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  53.06 
 
 
379 aa  359  5e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  51.7 
 
 
376 aa  358  8e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  51.7 
 
 
376 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  51.7 
 
 
376 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  51.7 
 
 
376 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  51.7 
 
 
376 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  51.7 
 
 
376 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  51.7 
 
 
376 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  49.74 
 
 
375 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  51.17 
 
 
376 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  48.05 
 
 
374 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  50.52 
 
 
378 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  51.44 
 
 
376 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  47.11 
 
 
372 aa  356  5e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  50.39 
 
 
377 aa  355  5.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
378 aa  355  6.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  48.83 
 
 
378 aa  355  6.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  49.08 
 
 
375 aa  355  7.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
374 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  50.97 
 
 
356 aa  355  8.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  50.42 
 
 
356 aa  354  1e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  51.18 
 
 
377 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  52.24 
 
 
374 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  49.08 
 
 
376 aa  354  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  50.78 
 
 
379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  50.78 
 
 
379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  50.78 
 
 
379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  50.78 
 
 
379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  50.78 
 
 
379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 
378 aa  353  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  50.52 
 
 
378 aa  352  5e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  48.3 
 
 
384 aa  352  5e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  49.22 
 
 
374 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  50.13 
 
 
380 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  49.35 
 
 
375 aa  352  7e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  52.37 
 
 
377 aa  352  8e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  51.05 
 
 
378 aa  352  8.999999999999999e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  50.39 
 
 
375 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  49.87 
 
 
378 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
378 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  48.96 
 
 
374 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  48.96 
 
 
374 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
378 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
378 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  49.87 
 
 
377 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  50.26 
 
 
378 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  50.39 
 
 
376 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  50.39 
 
 
376 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  50.39 
 
 
376 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  50.26 
 
 
378 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  49.87 
 
 
379 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2577  chaperone protein DnaJ  49.22 
 
 
385 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00027839 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  49.74 
 
 
378 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  50.65 
 
 
376 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  49.48 
 
 
379 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  49.48 
 
 
379 aa  350  3e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  49.48 
 
 
379 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2126  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
377 aa  349  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.549127  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  50.26 
 
 
379 aa  349  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>