More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2616 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2616  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  534  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1146  GntR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 271 aa  276  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  35.27 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  33.48 
 
 		 248 aa  118  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3616  GntR domain-containing protein  35.02 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.760095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3460  GntR domain-containing protein  33.47 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  30.26 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  30.6 
 
 		 239 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  35.5 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  31.53 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0711  GntR domain-containing protein  32.17 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.121808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  31.36 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  33.8 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  30.91 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  34.76 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  29.49 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  29.49 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  29.49 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1472  GntR domain-containing protein  29.2 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1451  GntR domain-containing protein  29.2 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3766  GntR domain protein  32.59 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  34.31 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 229 aa  99.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.82 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  29.82 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  29.82 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  29.82 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  29.82 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  29.82 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  29.82 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  29.82 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  32.42 
 
 		 287 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2982  transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  96.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3478  GntR domain protein  31.42 
 
 		 251 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.554366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  32.14 
 
 		 240 aa  95.9  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  32.26 
 
 		 240 aa  95.1  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  31.36 
 
 		 240 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  31.22 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1725  GntR domain protein  28.51 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  33.02 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  31.75 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1526  GntR domain-containing protein  29.2 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.72314 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1070  GntR-like  29.2 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1550  GntR domain-containing protein  29.2 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1682  GntR domain-containing protein  30.24 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4692  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468803  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0657  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.99 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  33.63 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3302  GntR domain protein  32.34 
 
 		 268 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  30.36 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  31.08 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3614  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.661468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2512  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.289571  normal  0.109373 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  29.11 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  31.43 
 
 		 257 aa  89  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1259  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 237 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.268862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1974  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 237 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1667  GntR domain-containing protein  28.11 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0248117 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1821  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 237 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1016  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 237 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1742  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 237 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0150  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 237 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0405244  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  33.02 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 226 aa  87  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  29.69 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  28.38 
 
 		 244 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  31.86 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1867  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0940  GntR domain protein  29.47 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  33.67 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  27.86 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  30.84 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  28.5 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  27.36 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  30.32 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  30.2 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1804  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>