More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4004 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 		 159 aa  333  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  55.48 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  54.09 
 
 		 163 aa  183  7e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.29 
 
 		 158 aa  180  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.64 
 
 		 183 aa  178  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  52.32 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.72 
 
 		 160 aa  166  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.33 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  42.77 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  49.67 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.77 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.38 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  43.71 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.63 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.87 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  44.81 
 
 		 157 aa  150  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  48.05 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.45 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  44.3 
 
 		 190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.74 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.4 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  43.08 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  42.38 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.31 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.05 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.46 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  45.16 
 
 		 148 aa  121  5e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  38.93 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.5 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.46 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.58 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  38.36 
 
 		 176 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.87 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  36 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  42 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.12 
 
 		 211 aa  110  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  36.05 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.97 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  36.3 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  37.74 
 
 		 188 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  35.86 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  36.42 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  36.42 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.12 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  47.41 
 
 		 186 aa  103  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.81 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  35.76 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.05 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.77 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.6 
 
 		 301 aa  101  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  48.96 
 
 		 163 aa  100  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.9 
 
 		 190 aa  100  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  43.51 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.18 
 
 		 223 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  41.35 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  41.35 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3095  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.84 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  48.42 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.14 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.47 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  38.1 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.38 
 
 		 162 aa  94.4  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.86 
 
 		 181 aa  94  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.9 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.27 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  43.81 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  34.4 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  39.39 
 
 		 183 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  34.4 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.16 
 
 		 182 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.16 
 
 		 150 aa  91.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.16 
 
 		 182 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.78 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 		 190 aa  91.3  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 182 aa  90.9  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.54 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  43.16 
 
 		 168 aa  90.5  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  35.77 
 
 		 158 aa  90.5  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.58 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  55.26 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  45.54 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.74 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  34.04 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  34.04 
 
 		 204 aa  88.6  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  41.35 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39680  Cytidine/deoxycytidylate deaminase-like protein  43.97 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774336  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  46.32 
 
 		 146 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.19 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1920  tRNA-adenosine deaminase  43 
 
 		 196 aa  87.8  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277263  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.68 
 
 		 148 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  42.06 
 
 		 151 aa  87.8  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.8 
 
 		 158 aa  87  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.38 
 
 		 162 aa  87  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.58 
 
 		 157 aa  87  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.96 
 
 		 147 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  37.39 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  44.79 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1349  hypothetical protein  40.62 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.39 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1675  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.32 
 
 		 197 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000564994  normal  0.585232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>