More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3326 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  52.38 
 
 		 189 aa  208  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  50 
 
 		 193 aa  201  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  52.94 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  47.15 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  48.81 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  40.91 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  39.77 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  38.64 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  41.95 
 
 		 182 aa  138  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  38.69 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  39.2 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  38.29 
 
 		 179 aa  134  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  37.36 
 
 		 182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  39.02 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  37.84 
 
 		 196 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  38.38 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  36.7 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  37.29 
 
 		 183 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  36.05 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  36.16 
 
 		 183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  39.08 
 
 		 175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  36.36 
 
 		 180 aa  127  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  37.28 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  40.46 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  38.82 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  37.5 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  39.68 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  36.9 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  34.55 
 
 		 182 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  35.64 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  36.05 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  36.9 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  35.84 
 
 		 197 aa  121  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  34.48 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  38.07 
 
 		 176 aa  121  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  35.26 
 
 		 190 aa  121  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  36.91 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  38.18 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  33.91 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  36.51 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  31.79 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  35.26 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  34.48 
 
 		 202 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  39.61 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  37.36 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  38.93 
 
 		 181 aa  118  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  39.05 
 
 		 196 aa  117  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  32.56 
 
 		 182 aa  117  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  35.8 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  39.6 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  38.18 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  35.29 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  31.55 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  37.5 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  39.6 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  39.6 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  38.41 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  32.14 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  33.92 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  35.06 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  36 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  36.52 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  35.16 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  35.84 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2711  hypothetical protein  35.09 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2768  hypothetical protein  35.09 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157098  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  35.84 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  35.03 
 
 		 182 aa  111  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  37.16 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  34.91 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2685  YceI family protein  37.29 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  34.52 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  34.78 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  32.42 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  33.88 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  31.79 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  33.72 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  32.79 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  33.73 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  30.06 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  37.34 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  34.88 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  37.24 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  33.33 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  29.41 
 
 		 220 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  31.98 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  35.09 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  31.32 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  33.74 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  34.46 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  31.1 
 
 		 194 aa  104  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  35.29 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  36.53 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  34.52 
 
 		 254 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  34.94 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  34.71 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  34.71 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  32.32 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  34.71 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>