More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3200 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3200  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  100 
 
 
861 aa  1785    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.469727  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0025  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.74 
 
 
838 aa  591  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.25 
 
 
882 aa  532  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0054  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.68 
 
 
641 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2337  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.52 
 
 
918 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225496  normal  0.289664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0133  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.65 
 
 
880 aa  364  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2588  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.4 
 
 
931 aa  357  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0841472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4612  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.9 
 
 
870 aa  347  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.25 
 
 
1001 aa  317  8e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.25 
 
 
868 aa  306  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126138  normal  0.134869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3942  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.97 
 
 
864 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0662737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3218  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.23 
 
 
822 aa  281  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3317  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.81 
 
 
957 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2898  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.42 
 
 
982 aa  251  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3465  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.01 
 
 
943 aa  244  7e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1287  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.41 
 
 
941 aa  238  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000172415  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2790  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.16 
 
 
938 aa  238  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00120618  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2979  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.01 
 
 
931 aa  237  9e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.99 
 
 
938 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00727633  normal  0.0393451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2889  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.92 
 
 
938 aa  234  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00315446  decreased coverage  0.00000356203 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1539  hypothetical protein  29.48 
 
 
529 aa  232  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.45 
 
 
989 aa  229  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2759  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.7 
 
 
937 aa  229  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000369969  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.67 
 
 
944 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257397  hitchhiker  0.00000788258 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1394  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.67 
 
 
944 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.4092  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.67 
 
 
944 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229344  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1369  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.67 
 
 
944 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0132501  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2422  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.07 
 
 
942 aa  228  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0305723  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2778  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.2 
 
 
955 aa  225  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3558  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.37 
 
 
870 aa  175  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212097  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.54 
 
 
845 aa  175  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3037  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.97 
 
 
847 aa  164  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581469  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3243  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.43 
 
 
824 aa  132  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.656974  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.43 
 
 
822 aa  125  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1754  hypothetical protein  29.75 
 
 
841 aa  119  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  27.21 
 
 
648 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1987  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.86 
 
 
813 aa  91.3  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.83 
 
 
682 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2242  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.74 
 
 
807 aa  89.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140093  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.84 
 
 
688 aa  89.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.62 
 
 
692 aa  89.4  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.82 
 
 
680 aa  89  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.28 
 
 
692 aa  87  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0816  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.48 
 
 
665 aa  84  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000784893  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.41 
 
 
751 aa  83.2  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0284  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.1 
 
 
686 aa  82  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.65 
 
 
652 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1251  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.81 
 
 
638 aa  81.6  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  26.54 
 
 
656 aa  79.7  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25 
 
 
689 aa  79  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.66 
 
 
652 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1065  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.12 
 
 
667 aa  78.6  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  25.73 
 
 
656 aa  78.2  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4957  hypothetical protein  25.73 
 
 
693 aa  78.2  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  23.64 
 
 
655 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  23.64 
 
 
654 aa  78.2  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  23.64 
 
 
654 aa  78.2  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0904  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.81 
 
 
664 aa  77.8  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.496036  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5739  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.75 
 
 
735 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  24.46 
 
 
691 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.91 
 
 
654 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  24.91 
 
 
652 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  24 
 
 
655 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  22.55 
 
 
655 aa  74.3  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0100  hypothetical protein  25.58 
 
 
656 aa  73.9  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.338515  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.12 
 
 
691 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.24 
 
 
667 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.33 
 
 
697 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.2 
 
 
666 aa  73.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.346688  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  26.47 
 
 
688 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.91 
 
 
708 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3865  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.88 
 
 
741 aa  73.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  28.17 
 
 
729 aa  73.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.2 
 
 
675 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24 
 
 
660 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.2 
 
 
631 aa  72.8  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4193  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.57 
 
 
688 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259535  normal  0.164737 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.18 
 
 
673 aa  72  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.9 
 
 
681 aa  72  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.9 
 
 
681 aa  72  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.02 
 
 
645 aa  72  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  24.81 
 
 
675 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0810  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.51 
 
 
719 aa  71.2  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0412357  normal  0.0214856 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.69 
 
 
910 aa  71.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.9 
 
 
681 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  22.91 
 
 
655 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.81 
 
 
692 aa  70.5  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0410  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  29.29 
 
 
712 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0851483 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.64 
 
 
677 aa  70.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00782  Dipeptidyl peptidase IV  25.36 
 
 
741 aa  70.5  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118527  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.11 
 
 
673 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.12 
 
 
698 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.11 
 
 
673 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.11 
 
 
698 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0613  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.28 
 
 
655 aa  68.6  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.23 
 
 
680 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.23 
 
 
672 aa  68.2  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.86 
 
 
596 aa  67.4  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  24.92 
 
 
735 aa  66.6  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  20.73 
 
 
654 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>