118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2840 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2840  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  100 
 
 
442 aa  923    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000828048  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3173  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  57.11 
 
 
440 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0592  lysine/ornithine N-monooxygenase  53.15 
 
 
447 aa  467  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301691  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0286  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  52.44 
 
 
455 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0513  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  52.55 
 
 
458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1454  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  51.06 
 
 
496 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50.35 
 
 
495 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2447  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  51.16 
 
 
432 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3189  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  51.16 
 
 
432 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.603333  normal  0.0134512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2546  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  51.16 
 
 
432 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1510  siderophore biosynthesis protein  50.12 
 
 
496 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3030  siderophore biosynthesis protein  49.54 
 
 
498 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2411  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  49.88 
 
 
505 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50.82 
 
 
501 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.242413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3460  L-lysine 6-monooxygenase  50.59 
 
 
434 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2708  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50.59 
 
 
501 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2730  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50.35 
 
 
501 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.100586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1656  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50.59 
 
 
501 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1054  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  48.6 
 
 
463 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0135  siderophore biosynthetis protein  47.33 
 
 
442 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4294  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  49.88 
 
 
432 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093868  hitchhiker  0.0000660921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1073  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  46.58 
 
 
502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118854  normal  0.903474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  48.36 
 
 
428 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2739  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  48.13 
 
 
428 aa  398  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0408  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  45.39 
 
 
431 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0197  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  46.15 
 
 
456 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0156088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2835  monooxygenase  45.24 
 
 
427 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4219  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  44.65 
 
 
457 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1802  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.52 
 
 
496 aa  350  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000066726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0217  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.91 
 
 
502 aa  348  1e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3333  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.33 
 
 
449 aa  342  7e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1630  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.42 
 
 
445 aa  330  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02102  hypothetical protein  37.88 
 
 
468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1817  putative siderophore biosynthesis oxidoreductase protein  41.11 
 
 
462 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0659  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38 
 
 
471 aa  318  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.95 
 
 
505 aa  299  7e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1810  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.44 
 
 
442 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0280  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.99 
 
 
441 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0211  L-lysine 6-monooxygenase  32.29 
 
 
427 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606934  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1946  hypothetical protein  30.19 
 
 
445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.24 
 
 
442 aa  217  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.82 
 
 
437 aa  213  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.62 
 
 
435 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0711  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucD  31.14 
 
 
442 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0783  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.14 
 
 
442 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.57 
 
 
445 aa  206  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0919  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.18 
 
 
442 aa  205  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.245016  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  29.33 
 
 
425 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1046  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.48 
 
 
437 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.69 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.730683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.05 
 
 
444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  30.28 
 
 
438 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  29.83 
 
 
437 aa  194  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3318  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.23 
 
 
441 aa  188  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00871217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3091  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.4 
 
 
454 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.169338  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0571  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.78 
 
 
434 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1811  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.33 
 
 
426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2654  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.25 
 
 
445 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000731675  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.85 
 
 
452 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3275  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.88 
 
 
430 aa  163  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  27.66 
 
 
458 aa  162  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0586  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  25.17 
 
 
444 aa  162  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5066  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.07 
 
 
442 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3723  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.77 
 
 
452 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  27.48 
 
 
443 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5949  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27 
 
 
463 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3740  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.31 
 
 
439 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1825  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.4 
 
 
435 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6320  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.83 
 
 
446 aa  146  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4789  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.52 
 
 
458 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00013329  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1540  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.13 
 
 
458 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.310035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3060  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.19 
 
 
439 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  26.18 
 
 
438 aa  144  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1561  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.13 
 
 
458 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000104933  normal  0.191057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  28.81 
 
 
455 aa  143  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05823  Ornithine monooxygenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8P5]  25.61 
 
 
498 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.56 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  26.83 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  26.83 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1618  lysine/ornithine N-monooxygenase  26.83 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00185713 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1869  putative peptide monooxygenase  27.63 
 
 
438 aa  141  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4036  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.78 
 
 
462 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  26.44 
 
 
454 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1345  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  30.64 
 
 
446 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865314  normal  0.202415 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3622  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.11 
 
 
445 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1973  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  28.34 
 
 
444 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0295223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2660  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.81 
 
 
448 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4074  L-ornithine 5-monooxygenase  27.05 
 
 
456 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0146729  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2095  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  30.99 
 
 
444 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3796  L-ornithine N5-oxygenase  28.25 
 
 
444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902122  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2120  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  28.44 
 
 
444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0401511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0527  l-ornithine 5-monooxygenase  26.26 
 
 
456 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25600  L-ornithine N5-oxygenase-PvdA-like protein  26.11 
 
 
453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1859  L-ornithine N5-oxygenase  29.47 
 
 
445 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.886808  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3463  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.14 
 
 
444 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23385  hitchhiker  0.00214354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4488  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.67 
 
 
422 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2090  l-ornithine 5-monooxygenase  25.06 
 
 
495 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1623  l-ornithine 5-monooxygenase  25.23 
 
 
468 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  25.06 
 
 
468 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1944  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  25.06 
 
 
468 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>