254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0886 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0886  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
214 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.43 
 
 
214 aa  251  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.49 
 
 
214 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.49 
 
 
214 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.49 
 
 
214 aa  247  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.43 
 
 
214 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.43 
 
 
214 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.24 
 
 
212 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.46 
 
 
217 aa  245  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85169  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.52 
 
 
212 aa  245  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.49 
 
 
214 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.07 
 
 
214 aa  242  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.67 
 
 
214 aa  240  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.08 
 
 
265 aa  239  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000096585  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.29 
 
 
213 aa  238  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.13 
 
 
214 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.13 
 
 
214 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000023808  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.13 
 
 
214 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.13 
 
 
214 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.13 
 
 
214 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.13 
 
 
214 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.13 
 
 
214 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.07 
 
 
211 aa  234  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.92 
 
 
213 aa  234  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.63 
 
 
213 aa  234  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.74 
 
 
214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.73 
 
 
211 aa  231  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.55 
 
 
211 aa  230  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.98 
 
 
212 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.24 
 
 
212 aa  225  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.13 
 
 
229 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.76 
 
 
212 aa  225  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.63 
 
 
211 aa  225  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.17 
 
 
212 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410968  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.76 
 
 
212 aa  224  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.7 
 
 
215 aa  223  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3944  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.58 
 
 
215 aa  223  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000793587  normal  0.125259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2564  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.58 
 
 
212 aa  222  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.252364  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.9 
 
 
217 aa  221  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3713  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.11 
 
 
226 aa  221  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.7 
 
 
213 aa  221  8e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.63 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2989  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.38 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274237  normal  0.310077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4542  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.76 
 
 
214 aa  218  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2931  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.16 
 
 
224 aa  218  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.05 
 
 
211 aa  217  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.7 
 
 
215 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2059  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.46 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0352298  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.63 
 
 
215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.63 
 
 
215 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0417  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.64 
 
 
213 aa  213  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2922  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.13 
 
 
211 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.969034 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.77 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.183278  normal  0.448099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.23 
 
 
215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1881  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.77 
 
 
217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.71 
 
 
239 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.41957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2803  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.95 
 
 
225 aa  211  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00595972  normal  0.551671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2888  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
210 aa  210  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877962  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0521  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.94 
 
 
214 aa  210  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  hitchhiker  0.00802215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.3 
 
 
215 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.3 
 
 
215 aa  208  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.37 
 
 
215 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.84 
 
 
215 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1006  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  48.8 
 
 
217 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1714  pyridoxamine-phosphate oxidase  46.73 
 
 
214 aa  206  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2893  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.33 
 
 
213 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3489  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
214 aa  203  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.481543  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.87 
 
 
212 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.87 
 
 
212 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.37 
 
 
215 aa  201  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187849  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11923  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.75 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  44.55 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8786  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.91 
 
 
231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1992  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.93 
 
 
213 aa  196  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4533  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.5 
 
 
202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2817  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.39 
 
 
211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  44.08 
 
 
215 aa  195  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3586  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.05 
 
 
215 aa  195  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63325  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.34 
 
 
212 aa  194  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.182808  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4707  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.95 
 
 
225 aa  194  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0829  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.26 
 
 
212 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.64 
 
 
218 aa  192  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29241  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.33 
 
 
222 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.39 
 
 
221 aa  191  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32246  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1726  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.24 
 
 
232 aa  191  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.230905  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001014  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.71 
 
 
211 aa  191  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0021  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.14 
 
 
211 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.479852  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07092  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.24 
 
 
211 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.29 
 
 
211 aa  189  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.21 
 
 
215 aa  190  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.45 
 
 
261 aa  188  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1634  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.5 
 
 
212 aa  188  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420266  normal  0.0379481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.5 
 
 
212 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1693  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.24 
 
 
233 aa  187  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0861149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0734  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.2 
 
 
213 aa  187  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1772  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.81 
 
 
217 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.382068  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.81 
 
 
217 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185253  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1880  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.81 
 
 
240 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.863598  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.19 
 
 
215 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225533  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.51 
 
 
224 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>