74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0909 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  401  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  42.55 
 
 		 148 aa  99.4  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  32.06 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  31.3 
 
 		 164 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  31.3 
 
 		 164 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  35.43 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2186  hypothetical protein  33.59 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1897  hypothetical protein  33.59 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  34.72 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  33.8 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  34.15 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1713  hypothetical protein  30.95 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1843  hypothetical protein  34.46 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0266883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1562  hypothetical protein  34.46 
 
 		 163 aa  72  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  28.47 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  30.43 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0233  hypothetical protein  35.11 
 
 		 150 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1503  hypothetical protein  26.71 
 
 		 157 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0163258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  36.09 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  35.19 
 
 		 142 aa  62  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  27.91 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  30 
 
 		 478 aa  58.9  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  25.22 
 
 		 440 aa  51.6  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  29.9 
 
 		 156 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  25.74 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  27.46 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  29.07 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  29.07 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  29.07 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  29.07 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  29.07 
 
 		 156 aa  48.9  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  26.74 
 
 		 156 aa  48.5  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  26.74 
 
 		 155 aa  48.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  23.4 
 
 		 155 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  30.68 
 
 		 157 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  24.16 
 
 		 154 aa  46.6  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  27.46 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  30.85 
 
 		 465 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  24.81 
 
 		 415 aa  45.8  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  25 
 
 		 177 aa  45.4  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  25.58 
 
 		 155 aa  45.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  26.92 
 
 		 464 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3692  hypothetical protein  27.78 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000191847  hitchhiker  0.00156887 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  26.76 
 
 		 164 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  32 
 
 		 498 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  22.83 
 
 		 461 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  24.71 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  30.68 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4595  hypothetical protein  27.78 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.2901e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  27.78 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000176607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4903  hypothetical protein  27.78 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105362  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3634  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4908  hypothetical protein  26.67 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  19.4 
 
 		 637 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  24.71 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  24.71 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  24.71 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  24.71 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  24.71 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  44.68 
 
 		 406 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  25.87 
 
 		 174 aa  42.7  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  27.5 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  42.4  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  23.89 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  29.55 
 
 		 163 aa  42  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  22.79 
 
 		 468 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  42.55 
 
 		 422 aa  41.6  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1291  hypothetical protein  25.3 
 
 		 154 aa  41.2  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.762277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>