108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2448 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  361  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2288  hypothetical protein  68 
 
 
197 aa  267  7e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  68.36 
 
 
177 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  58.66 
 
 
210 aa  228  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  57.39 
 
 
178 aa  223  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  58.86 
 
 
188 aa  217  7e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0162  hypothetical protein  66.26 
 
 
234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  35.96 
 
 
182 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15731  hypothetical protein  48.15 
 
 
203 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.448321 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  41.76 
 
 
186 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  45.34 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  40.38 
 
 
190 aa  117  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12081  hypothetical protein  48.87 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.525189  normal  0.755265 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  36.97 
 
 
188 aa  107  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  38.16 
 
 
187 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  39.18 
 
 
188 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.307666 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1279  hypothetical protein  40.52 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4069  hypothetical protein  38.69 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4044  hypothetical protein  38.69 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4162  hypothetical protein  38.69 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3967  hypothetical protein  38.69 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3329  hypothetical protein  37.57 
 
 
191 aa  90.9  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0322  hypothetical protein  40.27 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3651  hypothetical protein  37.5 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0293  hypothetical protein  37.5 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3847  hypothetical protein  37.5 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0402  hypothetical protein  37.28 
 
 
193 aa  89  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0256  hypothetical protein  35.9 
 
 
192 aa  88.2  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal  0.0986563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0283  hypothetical protein  38.16 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3665  hypothetical protein  40.27 
 
 
194 aa  87.8  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.821634  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3541  hypothetical protein  39.74 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.193134 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  29.73 
 
 
194 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  29.73 
 
 
194 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  29.73 
 
 
194 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  29.73 
 
 
194 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  29.73 
 
 
194 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  28.07 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  29.73 
 
 
188 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  29.73 
 
 
188 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  28.48 
 
 
194 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  28.48 
 
 
194 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  25.82 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  28.38 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  28.38 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  28.48 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  28.48 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  28.48 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  29.73 
 
 
195 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  28.32 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  28.32 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  27.75 
 
 
195 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  28.32 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  28.32 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  28.32 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  28.32 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  28.32 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  31.01 
 
 
195 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  28.38 
 
 
194 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  26.35 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  29.46 
 
 
195 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  29.46 
 
 
195 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  29.46 
 
 
195 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  29.46 
 
 
195 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  28.57 
 
 
195 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  29.46 
 
 
195 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  29.46 
 
 
195 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  26.34 
 
 
195 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  28.38 
 
 
194 aa  54.3  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  32.26 
 
 
195 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  27.27 
 
 
188 aa  54.3  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  35.23 
 
 
230 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  31.45 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  32 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000649  hypothetical protein  28.76 
 
 
259 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  29.19 
 
 
195 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  27.72 
 
 
231 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  31.78 
 
 
197 aa  52.4  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  29.25 
 
 
301 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  29.25 
 
 
301 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  31.47 
 
 
257 aa  51.6  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  27.43 
 
 
189 aa  50.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  30.58 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  29.17 
 
 
225 aa  50.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  30.15 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  27.17 
 
 
231 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  27.7 
 
 
200 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
185 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  30.64 
 
 
194 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  27.82 
 
 
230 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  28.89 
 
 
196 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  26.26 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  32.54 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  25.85 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  23.64 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  25.85 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  25.85 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  25 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  32.8 
 
 
297 aa  45.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  33.33 
 
 
194 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>