63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4044 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_4069  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4044  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4162  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3967  hypothetical protein  99.48 
 
 
194 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3665  hypothetical protein  86.08 
 
 
194 aa  308  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.821634  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3847  hypothetical protein  83.51 
 
 
193 aa  292  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0293  hypothetical protein  83.51 
 
 
193 aa  292  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0322  hypothetical protein  81.96 
 
 
193 aa  287  5.0000000000000004e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3651  hypothetical protein  82.99 
 
 
193 aa  287  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0256  hypothetical protein  71.88 
 
 
192 aa  255  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal  0.0986563 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  68.75 
 
 
188 aa  253  8e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  65.1 
 
 
190 aa  249  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0402  hypothetical protein  74.71 
 
 
193 aa  237  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  64.58 
 
 
187 aa  229  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0283  hypothetical protein  70.31 
 
 
188 aa  222  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3329  hypothetical protein  75.15 
 
 
191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  60.23 
 
 
186 aa  187  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  49.21 
 
 
188 aa  166  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.307666 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1279  hypothetical protein  57.58 
 
 
188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3541  hypothetical protein  55.76 
 
 
181 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.193134 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  46.56 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  39.47 
 
 
178 aa  129  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15731  hypothetical protein  49.11 
 
 
203 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.448321 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  50.31 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  38.97 
 
 
188 aa  115  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  39.77 
 
 
177 aa  115  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2288  hypothetical protein  35.75 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  38.69 
 
 
178 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12081  hypothetical protein  43.4 
 
 
185 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.525189  normal  0.755265 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  39.31 
 
 
182 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0162  hypothetical protein  37.5 
 
 
234 aa  102  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  30.52 
 
 
230 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  30.28 
 
 
189 aa  51.6  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  28.33 
 
 
233 aa  51.6  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  30.88 
 
 
233 aa  48.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  30.95 
 
 
189 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  25.49 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  32.14 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  30.95 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  26.34 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  26.84 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  30.56 
 
 
195 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  28 
 
 
194 aa  44.7  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  29.36 
 
 
297 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  32.35 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  30.08 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  29.03 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  28.44 
 
 
299 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  28.8 
 
 
200 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  30.77 
 
 
274 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  28.57 
 
 
257 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  26.89 
 
 
195 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  26.89 
 
 
195 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  26.89 
 
 
195 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  26.89 
 
 
195 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  26.89 
 
 
195 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  26.89 
 
 
195 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  26.89 
 
 
195 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3754  putative lipoprotein  30.48 
 
 
194 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  26.89 
 
 
195 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  30.53 
 
 
195 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  30.53 
 
 
194 aa  41.6  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  33.33 
 
 
192 aa  41.2  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>