215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1392 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  655    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  79.38 
 
 
333 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  64.69 
 
 
325 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  60.5 
 
 
327 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  61.56 
 
 
323 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  61.88 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 
506 aa  391  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  63.39 
 
 
295 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  59.5 
 
 
321 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  57.81 
 
 
325 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  54.23 
 
 
321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  52.78 
 
 
324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  58.93 
 
 
288 aa  352  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  53.61 
 
 
321 aa  352  7e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  53.92 
 
 
319 aa  350  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  54.32 
 
 
321 aa  345  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  54.32 
 
 
321 aa  345  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  50.61 
 
 
324 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  53.25 
 
 
321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  54.32 
 
 
321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  51.41 
 
 
321 aa  341  8e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  54.01 
 
 
321 aa  340  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  55.1 
 
 
327 aa  340  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  52.04 
 
 
321 aa  334  9e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  51.1 
 
 
321 aa  333  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  50.78 
 
 
321 aa  332  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  49.06 
 
 
325 aa  323  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  46.25 
 
 
338 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  46.56 
 
 
316 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  45.94 
 
 
335 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  42.81 
 
 
340 aa  269  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  41.74 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  46.35 
 
 
334 aa  252  6e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  43.65 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  41.54 
 
 
326 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  68.92 
 
 
160 aa  225  9e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  43.69 
 
 
323 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  49.42 
 
 
180 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0922  protein of unknown function DUF1568  53.25 
 
 
176 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  32.28 
 
 
316 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  31.15 
 
 
321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  37.18 
 
 
318 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  43.09 
 
 
282 aa  150  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  34.96 
 
 
319 aa  149  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  35.12 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  43.09 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  30.19 
 
 
313 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  40.98 
 
 
312 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  36.65 
 
 
316 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  62.63 
 
 
112 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  31.69 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  31.21 
 
 
315 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  64.84 
 
 
101 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  37.63 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  37.63 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  32.22 
 
 
253 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  33.06 
 
 
241 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  35.35 
 
 
231 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  37.57 
 
 
326 aa  125  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  31.67 
 
 
253 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  33.06 
 
 
323 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  35.48 
 
 
287 aa  122  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  29.39 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  31.98 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  35.91 
 
 
312 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  29.39 
 
 
288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  35.9 
 
 
236 aa  119  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  34.44 
 
 
251 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  28.75 
 
 
288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  36.53 
 
 
250 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  37.64 
 
 
277 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  38.04 
 
 
236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  35.92 
 
 
239 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  53.47 
 
 
101 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  37.22 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  57.65 
 
 
97 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  35.92 
 
 
232 aa  113  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  40.4 
 
 
234 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  39.07 
 
 
336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  36.88 
 
 
241 aa  109  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  27.56 
 
 
258 aa  109  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1349  protein of unknown function DUF1568  77.46 
 
 
82 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.655489  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  33.48 
 
 
234 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2207  hypothetical protein  62.82 
 
 
81 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  34.07 
 
 
232 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  31.28 
 
 
245 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  35.23 
 
 
226 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  34.04 
 
 
287 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  34.97 
 
 
236 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  32.45 
 
 
216 aa  102  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  33.13 
 
 
252 aa  102  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  39.31 
 
 
235 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2216  hypothetical protein  63.38 
 
 
72 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1785  hypothetical protein  29.97 
 
 
264 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  31.07 
 
 
233 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  32.79 
 
 
234 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  30.88 
 
 
255 aa  97.4  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  32.65 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  36.84 
 
 
248 aa  94  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>