More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0969 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  77.44 
 
 
768 aa  1171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1865  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  78.75 
 
 
758 aa  1190  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.13806  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0850  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  74.71 
 
 
750 aa  1085  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1599  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  76.26 
 
 
762 aa  1137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85135  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0969  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  100 
 
 
759 aa  1530  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00014024  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  81.82 
 
 
770 aa  1198  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.826241  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0642  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  77.75 
 
 
770 aa  1115  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.31 
 
 
637 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  39.2 
 
 
695 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949191  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.46 
 
 
710 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5217  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  40 
 
 
693 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1993  NADH dehydrogenase subunit L  42.5 
 
 
715 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351523  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.56 
 
 
666 aa  423  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.59 
 
 
656 aa  422  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.41 
 
 
667 aa  422  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8763e-14 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2820  NADH dehydrogenase subunit L  38.91 
 
 
724 aa  419  1e-115  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586459  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.74 
 
 
676 aa  417  1e-115  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0758  NADH dehydrogenase subunit L  39.24 
 
 
706 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.74 
 
 
702 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.2 
 
 
624 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  40.28 
 
 
692 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4909  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.45 
 
 
635 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.31 
 
 
704 aa  405  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.65 
 
 
671 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  45.42 
 
 
620 aa  399  1e-110  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  55.98 
 
 
642 aa  402  1e-110  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  40.21 
 
 
695 aa  402  1e-110  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1194  NADH dehydrogenase subunit L  41.23 
 
 
711 aa  400  1e-110  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.98 
 
 
658 aa  401  1e-110  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564852  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.7 
 
 
645 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.062647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  42.03 
 
 
685 aa  398  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  41.11 
 
 
686 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  52.8 
 
 
628 aa  398  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3405  NADH dehydrogenase subunit L  47.58 
 
 
617 aa  399  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0251  NADH dehydrogenase subunit L  46.21 
 
 
713 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  40.14 
 
 
686 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2400  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  48.4 
 
 
669 aa  393  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.53 
 
 
630 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.93 
 
 
703 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.18 
 
 
705 aa  395  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  0.222128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.13 
 
 
642 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0660  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  49.38 
 
 
687 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  45.76 
 
 
636 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0280  NADH dehydrogenase subunit L  46.02 
 
 
713 aa  391  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346221  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  49.08 
 
 
682 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.26 
 
 
678 aa  392  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1925  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.46 
 
 
691 aa  391  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0506649  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  46.96 
 
 
663 aa  392  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.81 
 
 
675 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  48.66 
 
 
679 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  48.66 
 
 
679 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  48.66 
 
 
679 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  48.66 
 
 
679 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  48.66 
 
 
679 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  48.66 
 
 
679 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.44 
 
 
667 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  46.33 
 
 
650 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0293  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  48.21 
 
 
669 aa  389  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  51.26 
 
 
686 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5090  NADH dehydrogenase subunit L  46.98 
 
 
620 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  48.66 
 
 
679 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.64 
 
 
678 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.57 
 
 
679 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.02 
 
 
672 aa  385  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  46.43 
 
 
620 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  45.83 
 
 
620 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  45.81 
 
 
620 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0694  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.11 
 
 
672 aa  383  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.284575  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01641  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  46.98 
 
 
667 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.124159  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.13 
 
 
653 aa  385  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.58 
 
 
666 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  50.45 
 
 
688 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.97 
 
 
678 aa  382  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  45.63 
 
 
620 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.56 
 
 
681 aa  382  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5468  NADH dehydrogenase subunit L  46.23 
 
 
620 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02211  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  46.97 
 
 
668 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.292389  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  47.95 
 
 
670 aa  382  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1606  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  53.45 
 
 
610 aa  379  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.483904  normal  0.915409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.94 
 
 
627 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  40.12 
 
 
695 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26701  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  48.11 
 
 
670 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2616  NADH dehydrogenase I chain L  43.58 
 
 
685 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1746  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  49.38 
 
 
696 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.275907  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5417  NADH dehydrogenase subunit L  46.23 
 
 
620 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.46 
 
 
671 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  37.54 
 
 
657 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  52.75 
 
 
674 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2802  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.34 
 
 
673 aa  379  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1153  NADH dehydrogenase I chain L  47.39 
 
 
669 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.66 
 
 
650 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1289  F420H2 dehydrogenase subunit L  37.24 
 
 
665 aa  378  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.32103e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  50.46 
 
 
692 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.8 
 
 
670 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5413  NADH dehydrogenase subunit L  45.83 
 
 
620 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.66 
 
 
685 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  37.36 
 
 
657 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1535  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  46.63 
 
 
691 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.91 
 
 
676 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.98 
 
 
642 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>