58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0081 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0081  peptidase E  100 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09678  peptidase E  60.27 
 
 		 235 aa  303  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1768  peptidase E  61.16 
 
 		 235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3280  peptidase E  62.5 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0167296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  44.49 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  45.29 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  44.86 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4173  peptidase E  45.96 
 
 		 249 aa  171  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156253  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  44.19 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  42.2 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2072  peptidase E  42.29 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02207  peptidase E  40.64 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0649813  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0798  peptidase E  43.26 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1245  peptidase E  41.4 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2596  peptidase E  41.28 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000701873  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  41.74 
 
 		 236 aa  158  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  41.74 
 
 		 236 aa  158  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  40.83 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1786  peptidase E  41.28 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161108  hitchhiker  0.0000000000738049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  38.43 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  40.35 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2558  peptidase E  40.83 
 
 		 237 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179137  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4442  peptidase E  39.37 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4403  peptidase E  39.37 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4525  peptidase E  39.37 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.289419  normal  0.285655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  39.37 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  40.64 
 
 		 251 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2673  peptidase E  40.37 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000331059  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03893  peptidase E  37.89 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3976  Dipeptidase E  37.89 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03853  hypothetical protein  37.89 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5491  peptidase E  37.89 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.831674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4257  peptidase E  37.89 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.618701  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4565  peptidase E  37.89 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4515  peptidase E  37.89 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4474  peptidase E  37.89 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.940329  normal  0.576842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4009  peptidase E  37.89 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  39.91 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  39.91 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1379  peptidase E  39.66 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  39.61 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  41.21 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0978  peptidase E  38.03 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4364  peptidase E  39.71 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0257  peptidase E  34.45 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.109084 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  33.01 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1748  peptidase S51 dipeptidase E  28.79 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  22.81 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  29.56 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  27.27 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  35.48 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3421  peptidase E-like protein  25.67 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  39.13 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1420  peptidase S51 dipeptidase E  27.86 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0221  peptidase S51 dipeptidase E  26.81 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3137  peptidase S51, dipeptidase E  31.87 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.638284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  26.28 
 
 		 204 aa  42  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00740  peptidase E  28.35 
 
 		 240 aa  41.6  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>