246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1200 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1200  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  100 
 
 		 450 aa  872    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.332542  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1199  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  78.67 
 
 		 445 aa  671    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.503617  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  68.39 
 
 		 444 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  68.61 
 
 		 444 aa  574  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  67.94 
 
 		 444 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  60.63 
 
 		 444 aa  536  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0958  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  59.69 
 
 		 448 aa  511  1e-144  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1503  cell division membrane protein FtsW/MrdB/SpoVE  59.91 
 
 		 448 aa  504  1e-141  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  56.89 
 
 		 447 aa  501  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1292  sodium- and chloride-dependent transporter  58.3 
 
 		 458 aa  477  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.889918  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  56.03 
 
 		 450 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1198  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  57.37 
 
 		 444 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0959  ModE family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.167837  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0530  sodium- and chloride-dependent transporter  54.23 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1504  sodium/neurotransmitter symporter family protein  51.12 
 
 		 443 aa  428  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0880  putative sodium transporter  51.33 
 
 		 446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0426981  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0941  sodium transporter, putative  51.11 
 
 		 446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1012  sodium transporter, putative  50.89 
 
 		 446 aa  405  1e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  37.74 
 
 		 486 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  38.06 
 
 		 446 aa  273  6e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  38.06 
 
 		 446 aa  273  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  38.06 
 
 		 446 aa  273  6e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  38.06 
 
 		 446 aa  272  7e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  37.22 
 
 		 470 aa  272  9e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  38.06 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  37.84 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  36.67 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  38.06 
 
 		 446 aa  270  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  38.06 
 
 		 446 aa  270  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  37.02 
 
 		 446 aa  270  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  37.61 
 
 		 446 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  37.5 
 
 		 454 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  36.36 
 
 		 461 aa  266  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  37.22 
 
 		 464 aa  263  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  36.57 
 
 		 446 aa  261  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  37.5 
 
 		 453 aa  260  4e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  35.41 
 
 		 452 aa  259  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  35.96 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  36.89 
 
 		 450 aa  257  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  36.89 
 
 		 450 aa  256  4e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  37.15 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  34.6 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  36.32 
 
 		 464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  35.82 
 
 		 453 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  33.85 
 
 		 455 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  33.63 
 
 		 455 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  34.38 
 
 		 446 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  34.79 
 
 		 486 aa  246  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  37.72 
 
 		 445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  34.88 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  35.7 
 
 		 457 aa  242  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  37.64 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  37.04 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  37.64 
 
 		 445 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  37.64 
 
 		 445 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  35.93 
 
 		 466 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  37.42 
 
 		 445 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  37.42 
 
 		 445 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  37.42 
 
 		 445 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  37.42 
 
 		 445 aa  239  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  34.31 
 
 		 449 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  36.09 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  37.39 
 
 		 445 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  35.81 
 
 		 443 aa  236  9e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  37.12 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  37.25 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  36.08 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  31.96 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  35.41 
 
 		 453 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  34.89 
 
 		 450 aa  231  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  33.78 
 
 		 476 aa  230  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  34.44 
 
 		 461 aa  230  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  33.7 
 
 		 457 aa  229  9e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  34.67 
 
 		 449 aa  229  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  33.05 
 
 		 458 aa  227  3e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  34.66 
 
 		 455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  32.18 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  33.33 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  32.6 
 
 		 454 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  33.56 
 
 		 454 aa  220  5e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  32.44 
 
 		 454 aa  219  6e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  33.03 
 
 		 454 aa  219  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  35.27 
 
 		 463 aa  219  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  34.59 
 
 		 453 aa  219  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  33.92 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  33.92 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  34.48 
 
 		 478 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  38.69 
 
 		 452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  38.69 
 
 		 451 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  38.69 
 
 		 452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  38.69 
 
 		 451 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  38.69 
 
 		 452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 		 465 aa  216  7e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  33.05 
 
 		 467 aa  216  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  38.69 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  33.55 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  38.69 
 
 		 452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  35.65 
 
 		 475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  32.38 
 
 		 457 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>