More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0894 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0894  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate synthesis protein  100 
 
 
188 aa  371  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.022908  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0914  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  76.47 
 
 
189 aa  290  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0908  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  75.94 
 
 
189 aa  288  2e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0978  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  75.4 
 
 
189 aa  287  7e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2034  DJ-1 family protein  50.79 
 
 
184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  42.7 
 
 
185 aa  149  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  41.18 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0481  DJ-1 family protein  42.78 
 
 
183 aa  136  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.476054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  42.39 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0623  DJ-1 family protein  45.41 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.226753  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  41.71 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  41.18 
 
 
191 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  38.59 
 
 
179 aa  123  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1633  protein ThiJ  39.68 
 
 
182 aa  121  5e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0634  ThiJ/PfpI family protein  36.36 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.403728 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  37.1 
 
 
182 aa  118  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4036  DJ-1 family protein  37.97 
 
 
183 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  39.25 
 
 
183 aa  115  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  39.55 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0371  DJ-1 family protein  39.13 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00995133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  35.29 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  36.22 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2774  DJ-1 family protein  37.36 
 
 
202 aa  106  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  35.48 
 
 
180 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1780  DJ-1  37.79 
 
 
185 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 
388 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1208  DJ-1 family protein  34.22 
 
 
188 aa  101  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  34.41 
 
 
180 aa  101  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1895  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  33.15 
 
 
201 aa  99.8  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32791  predicted protein  32.64 
 
 
191 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_127  DJ-1, 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  34.41 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03289  hypothetical protein  31.64 
 
 
199 aa  99  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0966  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  35.45 
 
 
182 aa  99  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000883438  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0510  DJ-1 family protein  32.8 
 
 
182 aa  98.6  5e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000981591  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002695  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis enzyme  32.63 
 
 
199 aa  98.2  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  35.84 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0640  putative 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  35 
 
 
184 aa  96.3  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00127997  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  33.9 
 
 
187 aa  95.1  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1009  DJ-1 family protein  35.09 
 
 
183 aa  94.7  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047613  normal  0.605199 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  33.71 
 
 
203 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1523  DJ-1 family protein  34.54 
 
 
190 aa  94  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  33.71 
 
 
203 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0941  protein ThiJ  33.52 
 
 
196 aa  92  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.963617  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl263  putative intracellular protease/amidase  29.57 
 
 
181 aa  89  3e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.04249e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2019  DJ-1 family protein  33.16 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.236764  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  30.48 
 
 
190 aa  87  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0833  DJ-1 family protein  31.72 
 
 
183 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620178  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2354  DJ-1 family protein  36.26 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0457203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2890  DJ-1 family protein  35.5 
 
 
196 aa  85.9  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0832  DJ-1 family protein  31.02 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0233882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3290  DJ-1 family protein  32.24 
 
 
184 aa  85.5  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3081  DJ-1 family protein  34.91 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.713776  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1082  DJ-1 family protein  34.52 
 
 
196 aa  82  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2299  DJ-1/PfpI family protein  30.57 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0326  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  32.96 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000260198  hitchhiker  6.98835e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1034  DJ-1 family protein  30.32 
 
 
196 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  28.11 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3209  DJ-1 family protein  32.39 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000549408 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3185  DJ-1 family protein  32.39 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3277  DJ-1 family protein  30.85 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00372  hypothetical protein  31.82 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00376  hypothetical protein  31.82 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0346  DJ-1 family protein  31.82 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  29.28 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0508  DJ-1 family protein  31.82 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44518  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0460  DJ-1 family protein  31.82 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0496  DJ-1 family protein  31.82 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0456  DJ-1 family protein  31.82 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3249  DJ-1 family protein  29.79 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3107  DJ-1 family protein  29.79 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44270  predicted protein  32.37 
 
 
253 aa  74.7  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0563651 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0891  DJ-1 family protein  30.69 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915837  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3069  DJ-1 family protein  29.79 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3445  thiJ/pfpI family protein  30.73 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000555251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3715  thiJ/pfpI family protein  30.73 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3357  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  31.28 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000501015  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2085  ThiJ/PfpI domain protein  32.2 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0486  ThiJ/PfpI domain protein  28.73 
 
 
193 aa  72  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1553  thiJ/pfpI family protein  30.17 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454916  normal  0.0345603 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1314  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.39 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.02067e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2146  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.39 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.21104e-22 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4431  ThiJ/PfpI domain protein  29.02 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4150  ThiJ/PfpI domain protein  29.9 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3408  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  30.17 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163373  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1190  ThiJ/PfpI domain protein  32.39 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00457983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3763  thiJ/pfpI family protein  30.73 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0065  ThiJ/PfpI domain protein  29.02 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3688  thiJ/pfpI family protein  30.73 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000554437  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0802  DJ-1/PfpI family protein  28.5 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0843  ThiJ/PfpI domain protein  31.32 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3683  thiJ/pfpI family protein  30.56 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00698458  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  28.99 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0031  ThiJ/PfpI  28.98 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  28.89 
 
 
181 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3342  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.61 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000897289  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  29.03 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4895  DJ-1  29.05 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0083  ThiJ/PfpI domain protein  29.82 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1048  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.25 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2091  ThiJ/PfpI domain protein  30.77 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.616699  hitchhiker  3.51942e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>