More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3651 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  100 
 
 
107 aa  215  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  61.9 
 
 
106 aa  144  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  59.62 
 
 
109 aa  139  1e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  59.43 
 
 
110 aa  137  4e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  52.94 
 
 
107 aa  127  4e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  52.48 
 
 
107 aa  127  5e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  52.43 
 
 
115 aa  125  2e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  52.94 
 
 
107 aa  124  4e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  56 
 
 
113 aa  124  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  123  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  122  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  50.48 
 
 
108 aa  122  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  52.83 
 
 
106 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  50.94 
 
 
107 aa  121  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  50.96 
 
 
108 aa  120  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  52.88 
 
 
106 aa  120  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  50.49 
 
 
123 aa  120  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  120  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  51.89 
 
 
106 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  52 
 
 
108 aa  120  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  7.56824e-06  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  51.89 
 
 
106 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  52.88 
 
 
108 aa  119  1e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  119  2e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  119  2e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  48.08 
 
 
108 aa  119  2e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  52.48 
 
 
107 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  48.11 
 
 
106 aa  118  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  47.57 
 
 
107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  47.57 
 
 
107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  50 
 
 
106 aa  117  4e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  117  5e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  50 
 
 
120 aa  117  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  117  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  117  7e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  51.96 
 
 
107 aa  116  1e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  115  2e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  51.92 
 
 
109 aa  115  2e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  48.45 
 
 
148 aa  115  2e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  54.9 
 
 
150 aa  115  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  50.96 
 
 
116 aa  115  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  52.69 
 
 
107 aa  114  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  50.54 
 
 
112 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  46.53 
 
 
107 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  50.96 
 
 
106 aa  115  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  50.49 
 
 
108 aa  114  4e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  47.52 
 
 
107 aa  113  8e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  50.49 
 
 
108 aa  113  8e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  113  8e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  51.46 
 
 
109 aa  113  9e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  46.53 
 
 
107 aa  113  9e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  46.53 
 
 
124 aa  113  9e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  49.04 
 
 
110 aa  113  1e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  48.11 
 
 
106 aa  112  1e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  52.63 
 
 
119 aa  112  1e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  45.54 
 
 
107 aa  112  1e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  45.54 
 
 
107 aa  112  1e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  45.54 
 
 
107 aa  112  1e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  50.5 
 
 
110 aa  112  1e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  52.63 
 
 
106 aa  113  1e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  51.58 
 
 
107 aa  112  1e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  46.53 
 
 
108 aa  112  2e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  47.52 
 
 
105 aa  112  2e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  50 
 
 
110 aa  112  2e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  52.75 
 
 
107 aa  112  2e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  2.65159e-07 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  111  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  7.62931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  43.43 
 
 
109 aa  111  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  111  4e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  111  4e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  5.34537e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  51.58 
 
 
106 aa  110  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  47.27 
 
 
115 aa  110  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  51.04 
 
 
106 aa  110  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  47.12 
 
 
108 aa  110  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  47.96 
 
 
106 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  43.43 
 
 
109 aa  110  7e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  50 
 
 
105 aa  110  7e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.01022e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  48.51 
 
 
112 aa  110  7e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  50 
 
 
110 aa  110  7e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  44.12 
 
 
125 aa  110  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  110  9e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  110  9e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  44.55 
 
 
107 aa  109  1e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  47.47 
 
 
106 aa  109  1e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  45.54 
 
 
110 aa  109  1e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  1.31883e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  47.17 
 
 
107 aa  109  1e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  50.98 
 
 
141 aa  109  1e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  50.51 
 
 
259 aa  109  1e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  47.42 
 
 
110 aa  108  2e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  50.55 
 
 
108 aa  108  2e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  49.47 
 
 
106 aa  109  2e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  51.58 
 
 
110 aa  108  2e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  45.28 
 
 
106 aa  108  2e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  45.54 
 
 
107 aa  108  2e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  47.52 
 
 
107 aa  108  2e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  4.45063e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  43.56 
 
 
103 aa  108  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  47.52 
 
 
107 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.30429e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  49.47 
 
 
108 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  45.54 
 
 
105 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>