225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2770 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 299 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  52.76 
 
 		 252 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  58.57 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  51.98 
 
 		 255 aa  248  8e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  58.73 
 
 		 249 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  54.03 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  54 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  55.08 
 
 		 254 aa  242  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  50.99 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  54.55 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  56.18 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  47.66 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  53.39 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  53.78 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  53.78 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  53.78 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  48.22 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  51.79 
 
 		 251 aa  235  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  53.15 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  53.75 
 
 		 264 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  57.32 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  48.61 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  52.59 
 
 		 249 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  51.97 
 
 		 252 aa  228  9e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  53.31 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  51.39 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  52.9 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  55.38 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 250 aa  222  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  53.6 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 250 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  54.33 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  48.81 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  47.01 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  54.98 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  55.16 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  54.55 
 
 		 255 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  45.52 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  41.7 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0535  LamB/YcsF family protein  53.15 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.884685  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  54.58 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 262 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  48.44 
 
 		 255 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 254 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 254 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  45.28 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  40.71 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  47.01 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  47.37 
 
 		 250 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  48.22 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  46.4 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  49.41 
 
 		 260 aa  205  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  45.2 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 254 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 254 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  43.48 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  51.97 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  49.21 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 		 247 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2226  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 		 254 aa  202  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  45.42 
 
 		 255 aa  201  9e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  48.8 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  46.06 
 
 		 261 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 		 256 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  46.06 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 274 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 274 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  48.58 
 
 		 254 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 254 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2862  hypothetical protein  42.46 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.477951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  44.22 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  42.91 
 
 		 244 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  47.01 
 
 		 255 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2118  hypothetical protein  42.46 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624243  normal  0.300984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  46.46 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2920  hypothetical protein  42.06 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  41.7 
 
 		 244 aa  193  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0803  LamB/YcsF family protein  41.7 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.179932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  41.7 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  41.7 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  43.9 
 
 		 253 aa  193  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  41.7 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  41.7 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  41.7 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  42.4 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  41.7 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  38 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  42 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>