159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1681 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  100 
 
 
225 aa  424  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  50 
 
 
224 aa  162  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  48.34 
 
 
231 aa  142  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  47.25 
 
 
216 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  44.66 
 
 
207 aa  119  4e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  43.19 
 
 
212 aa  109  4e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  40.32 
 
 
210 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  37.7 
 
 
197 aa  95.9  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  41.94 
 
 
194 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  41.94 
 
 
194 aa  92.4  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  58.16 
 
 
199 aa  92  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  45.33 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  41.24 
 
 
192 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  38.07 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  37.3 
 
 
187 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  38.38 
 
 
201 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  37.23 
 
 
187 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  38.71 
 
 
205 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  40.88 
 
 
202 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  40.88 
 
 
202 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  40.88 
 
 
202 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  37.43 
 
 
187 aa  86.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  47.06 
 
 
202 aa  81.3  1e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.12957e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  41.82 
 
 
192 aa  80.1  2e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  36.6 
 
 
189 aa  80.5  2e-14  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  40.11 
 
 
180 aa  80.5  2e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  34.81 
 
 
179 aa  79.7  3e-14  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  34.08 
 
 
191 aa  79  6e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  7.0307e-10  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  34.08 
 
 
191 aa  77.8  1e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  32.95 
 
 
184 aa  77  2e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  32.95 
 
 
184 aa  77  2e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  34.64 
 
 
191 aa  76.6  2e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.66456e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  41.99 
 
 
182 aa  76.6  3e-13  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  35.12 
 
 
184 aa  76.6  3e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  55 
 
 
188 aa  76.3  4e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  37.3 
 
 
189 aa  75.9  4e-13  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  47 
 
 
201 aa  76.3  4e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  50 
 
 
192 aa  75.9  5e-13  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  37.28 
 
 
179 aa  75.5  6e-13  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  37.43 
 
 
182 aa  75.1  8e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  9.40294e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  41.81 
 
 
215 aa  74.3  1e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  40.99 
 
 
204 aa  74.3  1e-12  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  32.24 
 
 
184 aa  73.6  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.66759e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  39.52 
 
 
205 aa  73.9  2e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  36.82 
 
 
207 aa  71.6  8e-12  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  36.02 
 
 
184 aa  71.6  8e-12  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  45.36 
 
 
184 aa  70.9  1e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  31.25 
 
 
179 aa  71.2  1e-11  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  9.49175e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  45.63 
 
 
206 aa  70.5  2e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  42.86 
 
 
198 aa  70.9  2e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  49.44 
 
 
208 aa  70.5  2e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  3.26686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  37.85 
 
 
189 aa  70.1  2e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  42 
 
 
197 aa  69.7  3e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  39.29 
 
 
197 aa  70.1  3e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  43 
 
 
197 aa  69.3  4e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  42.31 
 
 
197 aa  69.3  4e-11  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  42 
 
 
197 aa  69.3  5e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.01818e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  42 
 
 
197 aa  68.9  5e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  3.60294e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  42 
 
 
197 aa  69.3  5e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  42 
 
 
197 aa  68.9  5e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.12597e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  42 
 
 
197 aa  68.9  5e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  43.01 
 
 
222 aa  68.9  5e-11  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  35.08 
 
 
187 aa  68.9  6e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  41.57 
 
 
197 aa  68.9  6e-11  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  42 
 
 
197 aa  68.9  6e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  42 
 
 
197 aa  68.9  6e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  34.08 
 
 
191 aa  68.2  1e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  34.08 
 
 
191 aa  68.2  1e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.18504e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  34.08 
 
 
191 aa  68.2  1e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  5.93466e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  34.64 
 
 
191 aa  67.8  1e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  34.64 
 
 
191 aa  67.8  1e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  4.23922e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  38.86 
 
 
199 aa  67.8  1e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  40 
 
 
191 aa  67  2e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  34.64 
 
 
191 aa  67.4  2e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  31.15 
 
 
182 aa  66.2  4e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.2911e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  34.08 
 
 
191 aa  65.9  5e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  31.68 
 
 
180 aa  65.9  6e-10  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  37.25 
 
 
179 aa  65.1  9e-10  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.4315e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  54.93 
 
 
205 aa  64.7  1e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  29.55 
 
 
182 aa  64.7  1e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  32.95 
 
 
167 aa  64.7  1e-09  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.11141e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  49.49 
 
 
189 aa  63.5  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  45 
 
 
212 aa  63.5  2e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  34.97 
 
 
216 aa  63.5  3e-09  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3254e-06 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  45.36 
 
 
182 aa  62.4  5e-09  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  39.86 
 
 
197 aa  62.4  5e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  41.14 
 
 
189 aa  62  8e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  52.94 
 
 
195 aa  61.6  9e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  50 
 
 
203 aa  61.2  1e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  34.24 
 
 
187 aa  60.8  1e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  33.15 
 
 
190 aa  60.5  2e-08  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  42.71 
 
 
174 aa  60.5  2e-08  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  7.75885e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  47.52 
 
 
169 aa  60.5  2e-08  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  36.36 
 
 
200 aa  60.1  3e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  37.77 
 
 
179 aa  58.9  6e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  41.18 
 
 
182 aa  58.9  6e-08  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  41.58 
 
 
184 aa  58.5  8e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  41 
 
 
192 aa  58.2  9e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.69732e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  53.25 
 
 
195 aa  58.2  9e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  34.81 
 
 
187 aa  57.8  1e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>