87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13050 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_13050  molybdenum-binding protein  100 
 
 
115 aa  236  8e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.803513  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  65.17 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  52.34 
 
 
114 aa  113  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  35.96 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  41.05 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  37.07 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
115 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  37.5 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  41.33 
 
 
171 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  32.67 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  36.9 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  47.27 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  31 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  31.48 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0932  regulatory protein, LysR  36.47 
 
 
365 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  36.96 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  36.08 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2243  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  37.21 
 
 
366 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.963081  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  34.07 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  37.21 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  31.73 
 
 
138 aa  52  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1919  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  37.21 
 
 
366 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360263  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2092  hypothetical protein  33 
 
 
366 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  29.81 
 
 
135 aa  50.1  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  36.36 
 
 
111 aa  50.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  36.56 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  28.07 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  48.84 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  32.32 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  44 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  27.68 
 
 
242 aa  47.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0230  putative transcriptional regulator, ModE family  31.37 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  32.71 
 
 
195 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  31.25 
 
 
119 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
115 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  38 
 
 
118 aa  47  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  32.18 
 
 
137 aa  47  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0896  molybdate metabolism transcriptional regulator  40 
 
 
365 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  36 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  33.77 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  44.19 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3016  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  31.65 
 
 
370 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  35.56 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  26.92 
 
 
247 aa  44.3  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  30.86 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2849  regulatory protein LysR  32.95 
 
 
345 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  37.29 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  29.46 
 
 
118 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3075  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  39.71 
 
 
346 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  35.19 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  35.19 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  44.19 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  48.48 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3707  periplasmic-binding protein  37.84 
 
 
361 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.775197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
162 aa  42.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1508  molybdate metabolism transcriptional regulator  32 
 
 
375 aa  42.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  40.3 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1034  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.92 
 
 
368 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0555  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.92 
 
 
368 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0993  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.92 
 
 
368 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0233787  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0203  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  27.18 
 
 
374 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.433996  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  30.85 
 
 
233 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4147  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.92 
 
 
368 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.70321  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  26.19 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  41.86 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  29.41 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2224  molybdate metabolism transcriptional regulator  29.35 
 
 
375 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  43.24 
 
 
125 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1335  molybdate metabolism transcriptional regulator  46 
 
 
340 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2363  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.92 
 
 
368 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  47.06 
 
 
258 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  29.79 
 
 
233 aa  41.2  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0339  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.07 
 
 
358 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  29.79 
 
 
245 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1822  molybdate metabolism transcriptional regulator  31.25 
 
 
386 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1757  molybdate metabolism transcriptional regulator  30.67 
 
 
371 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
118 aa  40  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1450  molybdenum-binding protein  23.6 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0898  molybdate metabolism transcriptional regulator  35.38 
 
 
368 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0910  molybdate metabolism transcriptional regulator  35.38 
 
 
368 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527444  normal  0.0178578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3578  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
317 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
339 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>