More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09330 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
264 aa  535  1e-151  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  63.36 
 
 
260 aa  320  2e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  54.44 
 
 
265 aa  285  7e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  3.85147e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  55.43 
 
 
263 aa  263  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  50.39 
 
 
270 aa  253  2e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  54.37 
 
 
269 aa  251  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  53.28 
 
 
262 aa  245  7e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 
264 aa  244  9e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  48.65 
 
 
264 aa  244  1e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
272 aa  241  6e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 
267 aa  239  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  51.36 
 
 
267 aa  238  7e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  48.66 
 
 
257 aa  234  2e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 
270 aa  233  2e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 
270 aa  233  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  45.66 
 
 
270 aa  231  6e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
271 aa  228  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  49.25 
 
 
266 aa  228  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 
265 aa  225  5e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  50.75 
 
 
266 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
288 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  46.94 
 
 
264 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
268 aa  221  1e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  53.03 
 
 
271 aa  220  2e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  47.91 
 
 
270 aa  219  4e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  47.94 
 
 
271 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  46.34 
 
 
260 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  48.5 
 
 
268 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  48.3 
 
 
268 aa  216  3e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  48.53 
 
 
285 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 
260 aa  216  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  52.83 
 
 
269 aa  214  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  47.39 
 
 
264 aa  214  1e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 
268 aa  214  1e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 
268 aa  213  2e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 
288 aa  214  2e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 
288 aa  214  2e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  50.95 
 
 
280 aa  213  2e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 
277 aa  213  2e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  42.21 
 
 
270 aa  214  2e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  48.35 
 
 
285 aa  212  4e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 
268 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  48.86 
 
 
265 aa  210  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  43.55 
 
 
270 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
270 aa  208  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
270 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
270 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
270 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 
275 aa  208  6e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  44.26 
 
 
273 aa  208  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 
284 aa  208  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
270 aa  208  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
270 aa  208  9e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.10773e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 
264 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  51.49 
 
 
268 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  51.13 
 
 
269 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  51.13 
 
 
269 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 
263 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  51.31 
 
 
269 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 
285 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  50.75 
 
 
269 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  50.75 
 
 
269 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  42.02 
 
 
273 aa  206  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  45.17 
 
 
269 aa  206  4e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  43.44 
 
 
270 aa  205  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  42.42 
 
 
279 aa  205  7e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  50.79 
 
 
269 aa  205  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  43.03 
 
 
270 aa  204  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  47.35 
 
 
269 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  48.69 
 
 
283 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  43.03 
 
 
270 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  46.62 
 
 
267 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  48.91 
 
 
303 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  51.31 
 
 
269 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
276 aa  202  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
276 aa  202  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  51.3 
 
 
267 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
272 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  51.31 
 
 
269 aa  201  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  48.18 
 
 
303 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0889  phosphomethylpyrimidine kinase  49.45 
 
 
293 aa  201  1e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  6.98623e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  44.94 
 
 
269 aa  201  1e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 
273 aa  201  1e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  43.3 
 
 
266 aa  201  1e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  50.9 
 
 
277 aa  199  4e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  46.79 
 
 
264 aa  199  4e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 
267 aa  199  4e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  44.11 
 
 
436 aa  199  5e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  46.54 
 
 
267 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  48.46 
 
 
484 aa  198  8e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
518 aa  197  2e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
484 aa  197  2e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  45.09 
 
 
297 aa  197  2e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  47.29 
 
 
490 aa  196  2e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  47.73 
 
 
323 aa  196  2e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  48.87 
 
 
268 aa  196  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 
270 aa  196  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  196  4e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  1.67736e-05 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  48.18 
 
 
301 aa  196  4e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 
270 aa  196  4e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>