43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3219 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  42.42 
 
 
218 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  40.54 
 
 
208 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  37.13 
 
 
302 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  40.78 
 
 
232 aa  141  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  42.05 
 
 
238 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  41.5 
 
 
241 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  43.43 
 
 
234 aa  141  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  43.26 
 
 
258 aa  140  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  41.48 
 
 
238 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  43.43 
 
 
283 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  40.66 
 
 
246 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  43.18 
 
 
245 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  41.58 
 
 
221 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  38.33 
 
 
212 aa  136  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  45.83 
 
 
245 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  38.33 
 
 
300 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  41.58 
 
 
241 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  41.76 
 
 
240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  39.27 
 
 
241 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  45.75 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  41.67 
 
 
238 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  42.68 
 
 
300 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  37.75 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  41.42 
 
 
226 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  38.25 
 
 
195 aa  121  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  35.33 
 
 
202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  40.23 
 
 
213 aa  109  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  38.73 
 
 
218 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  41.73 
 
 
177 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  38.41 
 
 
182 aa  95.1  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  36.64 
 
 
176 aa  86.3  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  31.46 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  30.43 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  28.18 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  27.75 
 
 
196 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  26.29 
 
 
195 aa  61.6  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  26.44 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 
198 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  24.64 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  26.28 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  29.09 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  38 
 
 
242 aa  42.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>