More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7270 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  100 
 
 
500 aa  997  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.06 
 
 
505 aa  573  1e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.18 
 
 
503 aa  556  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.43 
 
 
517 aa  554  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  63.52 
 
 
450 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.95 
 
 
463 aa  548  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.27 
 
 
488 aa  549  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  61.72 
 
 
493 aa  548  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  64.3 
 
 
509 aa  548  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.89 
 
 
491 aa  538  1e-152  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  65.41 
 
 
519 aa  538  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  63.38 
 
 
509 aa  533  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  59.76 
 
 
513 aa  531  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  63.2 
 
 
529 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  63.62 
 
 
529 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  63.58 
 
 
516 aa  526  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  62.3 
 
 
481 aa  525  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1475  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.6 
 
 
486 aa  527  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1189  GTPase ObgE  62.74 
 
 
488 aa  520  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  62.01 
 
 
481 aa  519  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  62.35 
 
 
515 aa  513  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.66 
 
 
454 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.52 
 
 
450 aa  507  1e-142  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11560  GTPase ObgE  60.29 
 
 
500 aa  501  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.32436 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3621  GTPase ObgE  59.88 
 
 
485 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  61.08 
 
 
454 aa  495  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  62.33 
 
 
541 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3548  GTPase ObgE  59.88 
 
 
485 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3553  GTPase ObgE  59.88 
 
 
485 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5478  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.66 
 
 
480 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1222  GTPase ObgE  62.47 
 
 
529 aa  492  1e-138  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3944  GTPase ObgE  58.9 
 
 
480 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2637  GTPase ObgE  58.57 
 
 
482 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.869058  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  61.59 
 
 
476 aa  480  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1505  GTPase ObgE  58.78 
 
 
504 aa  475  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00667966  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12467  GTPase ObgE  57.67 
 
 
479 aa  478  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.642368  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  56.05 
 
 
563 aa  476  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  55.09 
 
 
560 aa  447  1e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.89684e-08 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.71 
 
 
464 aa  328  2e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.47894e-05  hitchhiker  3.62877e-14 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.01 
 
 
426 aa  320  4e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.64035e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.63 
 
 
463 aa  313  6e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.15 
 
 
464 aa  311  1e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  1.09453e-12 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.56 
 
 
482 aa  311  2e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  7.15993e-05  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  43.45 
 
 
427 aa  305  1e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.27765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.35 
 
 
425 aa  304  3e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.69 
 
 
437 aa  303  4e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  44.72 
 
 
432 aa  303  4e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  40.47 
 
 
423 aa  296  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  44.72 
 
 
428 aa  296  7e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  42.79 
 
 
422 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.5 
 
 
435 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  43.55 
 
 
430 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  43.55 
 
 
430 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  43.81 
 
 
435 aa  291  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  43.35 
 
 
435 aa  291  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.06 
 
 
458 aa  286  6e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  49.86 
 
 
354 aa  286  8e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  49.86 
 
 
354 aa  285  1e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  49.86 
 
 
354 aa  285  2e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  49.41 
 
 
338 aa  284  3e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.44 
 
 
425 aa  283  5e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.12054e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  48.97 
 
 
353 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  44.37 
 
 
419 aa  281  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  41.44 
 
 
428 aa  279  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  41.67 
 
 
428 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  41.9 
 
 
428 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  40.83 
 
 
424 aa  277  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  41.11 
 
 
427 aa  277  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  40.97 
 
 
428 aa  276  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  40.97 
 
 
428 aa  276  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  40.97 
 
 
428 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  41.94 
 
 
430 aa  276  6e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  4.54316e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  40.74 
 
 
428 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  41.2 
 
 
428 aa  276  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  40.74 
 
 
428 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.25 
 
 
439 aa  275  2e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.85 
 
 
426 aa  273  5e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  40.51 
 
 
428 aa  273  8e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  40.18 
 
 
434 aa  272  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  40.32 
 
 
424 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  46.75 
 
 
338 aa  269  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.12232e-08  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  41.11 
 
 
439 aa  267  3e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.56 
 
 
426 aa  266  5e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.37 
 
 
429 aa  266  6e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  46.18 
 
 
353 aa  266  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.44 
 
 
417 aa  265  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  46.31 
 
 
338 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  44.41 
 
 
346 aa  265  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  45.35 
 
 
425 aa  264  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  40.09 
 
 
424 aa  263  5e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  47.45 
 
 
338 aa  262  9e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  9.9426e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.08 
 
 
434 aa  262  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.99 
 
 
415 aa  262  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  9.3637e-06  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  39.86 
 
 
424 aa  261  1e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  47.45 
 
 
338 aa  262  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.9 
 
 
452 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  44.92 
 
 
370 aa  260  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  44.51 
 
 
362 aa  260  5e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  42.18 
 
 
439 aa  260  5e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  39.78 
 
 
437 aa  259  8e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>