70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2799 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2799  cytochrome c'  100 
 
 		 159 aa  324  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1989  cytochrome c, class II  50.64 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.13994  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02251  cytochrome c  43.12 
 
 		 170 aa  138  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2738  cytochrome c, class II  37.18 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000239572  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1134  cytochrome c, class II  37.18 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1075  cytochrome c, class II  38.21 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1223  cytochrome c, class II  34.44 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000308946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3090  cytochrome c prime  34.44 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000689857  normal  0.0144373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1300  cytochrome c prime  35.1 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000571925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1267  cytochrome c class II  34.44 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3420  cytochrome c'  36.54 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1135  cytochrome c, class II  36.54 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000323618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1205  cytochrome c, class II  36.54 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000342907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2910  cytochrome c, class II  35.57 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.963403  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1171  cytochrome c, class II  37.18 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3537  cytochrome c prime  32.69 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0147332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0216  cytochrome c, class II  32.86 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1062  cytochrome c class II  36.36 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.251364  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1266  cytochrome c prime  38.26 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0901  cytochrome c, class II  32.69 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0404  cytochrome c prime  35 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1340  cytochrome c prime  32.28 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000194758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0269  cytochrome c, class II  34.68 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1123  cytochrome c prime  29.53 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000239105  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1277  cytochrome c, class II  33.88 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0474  cytochrome c, class II  32.69 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.731529  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0600  cytochrome c, class II  32.89 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1325  cytochrome c, class II  30.67 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0462  cytochrome c'  29.14 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1106  cytochrome c, class II  28.95 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0474  cytochrome c'  37.1 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3135  cytochrome c prime  31.5 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2126  cytochrome c, class II  37.1 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1236  cytochrome C-556  32.77 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1427  cytochrome c, class II  31.37 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466816  normal  0.0348813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2396  cytochrome c, class II  36.89 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00865436  normal  0.433653 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2744  cytochrome c, class II  32.05 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2785  cytochrome c-554  30.72 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336484  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0291  cytochrome c, class II  30.58 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000294803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0286  cytochrome c prime  30.58 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0933227  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4700  cytochrome c, class II  30.87 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311415  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1455  cytochrome c, class II  23.49 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0590  cytochrome c class II  28.81 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2557  cytochrome c prime  33.05 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524451  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2695  cytochrome c class II  29.69 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.618119  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2544  cytochrome c, class II  28.91 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2229  cytochrome c, class II  25.64 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4496  cytochrome c prime  29.84 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.609438  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1043  cytochrome c, class II  26.8 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4122  hypothetical protein  26.92 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22167  normal  0.119493 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2868  cytochrome c  28.1 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1163  cytochrome c, class II  28 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1614  cytochrome c, class II  26.8 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5272  cytochrome c, class II  25 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3015  cytochrome c, class II  29.17 
 
 		 154 aa  47.4  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.628177  normal  0.504757 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0242  cytochrome c, class II  25.95 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00183316  normal  0.94125 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4420  cytochrome c, class II  23.93 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49090  Cytochrome C, class II  33.85 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.472535  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0112  cytochrome c prime  28.03 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.277441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0972  cytochrome c prime  26.5 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1225  cytochrome c prime  25.31 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0451  cytochrome c556-like protein  26.05 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07030  putative cytochrome c'  21.67 
 
 		 152 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3283  cytochrome c, class II  30.88 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00438456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1625  cytochrome c, class II  27.45 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0644  putative lipoprotein  20.83 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1785  cytochrome c prime  23.72 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.849922  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1296  Cytochrome c556-like protein  22.64 
 
 		 154 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.618676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0495  cytochrome c prime  20.17 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2023  cytochrome c prime  28.81 
 
 		 152 aa  40.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>