60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2868 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2868  cytochrome c  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2229  cytochrome c, class II  47.77 
 
 		 156 aa  121  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4700  cytochrome c, class II  46.34 
 
 		 151 aa  98.2  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311415  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1427  cytochrome c, class II  41.18 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466816  normal  0.0348813 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2785  cytochrome c-554  41.18 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2126  cytochrome c, class II  44.35 
 
 		 149 aa  91.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0474  cytochrome c'  43.55 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2396  cytochrome c, class II  43.55 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00865436  normal  0.433653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1043  cytochrome c, class II  43.38 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2544  cytochrome c, class II  35.04 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1989  cytochrome c, class II  35.22 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.13994  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2738  cytochrome c, class II  35.81 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000239572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3420  cytochrome c'  35.81 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1205  cytochrome c, class II  35.81 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000342907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1135  cytochrome c, class II  35.81 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000323618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0404  cytochrome c prime  36 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1123  cytochrome c prime  30.26 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000239105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1134  cytochrome c, class II  35.14 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1062  cytochrome c class II  37.8 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.251364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1300  cytochrome c prime  33.85 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000571925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02251  cytochrome c  34.13 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1236  cytochrome C-556  37.01 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0291  cytochrome c, class II  38.4 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000294803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1223  cytochrome c, class II  33.86 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000308946  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0590  cytochrome c class II  36.67 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0286  cytochrome c prime  37.6 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0933227  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3090  cytochrome c prime  33.86 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000689857  normal  0.0144373 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1267  cytochrome c class II  33.07 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1075  cytochrome c, class II  40.5 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0216  cytochrome c, class II  33.6 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2910  cytochrome c, class II  35.04 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.963403  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1340  cytochrome c prime  33.96 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000194758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1266  cytochrome c prime  31.75 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0901  cytochrome c, class II  33.54 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2695  cytochrome c class II  36.67 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.618119  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0269  cytochrome c, class II  34.13 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1277  cytochrome c, class II  35.71 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1171  cytochrome c, class II  34.71 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2799  cytochrome c'  28.93 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1296  Cytochrome c556-like protein  29.14 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.618676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0600  cytochrome c, class II  34.13 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0462  cytochrome c'  26.71 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3537  cytochrome c prime  29.33 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0147332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49090  Cytochrome C, class II  33.33 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.472535  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1225  cytochrome c prime  30.46 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0474  cytochrome c, class II  31.3 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.731529  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1106  cytochrome c, class II  27.52 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4496  cytochrome c prime  30.97 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.609438  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1625  cytochrome c, class II  29.09 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2744  cytochrome c, class II  30.08 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5606  cytochrome c, class II  34.11 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.325565 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3135  cytochrome c prime  26.61 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1325  cytochrome c, class II  33.97 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0972  cytochrome c prime  31.67 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1614  cytochrome c, class II  28.75 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1440  cytochrome c, class II  32.28 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2557  cytochrome c prime  29.94 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524451  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2083  hypothetical protein  26.35 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0327  cytochrome c, class II  27.21 
 
 		 153 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.781322  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3283  cytochrome c, class II  29.32 
 
 		 152 aa  42  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00438456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>