61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1225 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1225  cytochrome c prime  100 
 
 		 155 aa  316  6e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1296  Cytochrome c556-like protein  56.77 
 
 		 154 aa  180  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.618676  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1163  cytochrome c, class II  54.68 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3537  cytochrome c prime  33.77 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0147332 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1340  cytochrome c prime  30.72 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000194758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1300  cytochrome c prime  29.49 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000571925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1135  cytochrome c, class II  31.41 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000323618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1205  cytochrome c, class II  31.41 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000342907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3090  cytochrome c prime  28.85 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000689857  normal  0.0144373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1223  cytochrome c, class II  28.85 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000308946  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2256  cytochrome c, class II  30.33 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.335708  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1267  cytochrome c class II  28.85 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1106  cytochrome c, class II  29.68 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0474  cytochrome c, class II  30.22 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.731529  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1134  cytochrome c, class II  30.77 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0404  cytochrome c prime  32 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3420  cytochrome c'  30.13 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0901  cytochrome c, class II  30.13 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1062  cytochrome c class II  31.58 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.251364  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02251  cytochrome c  27.74 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2738  cytochrome c, class II  30.13 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000239572  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1325  cytochrome c, class II  33.8 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2695  cytochrome c class II  34.64 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.618119  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0600  cytochrome c, class II  26.92 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0462  cytochrome c'  31.69 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1123  cytochrome c prime  32.64 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000239105  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0041  cytochrome c, class II  29.94 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1075  cytochrome c, class II  31.25 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0216  cytochrome c, class II  30.16 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1236  cytochrome C-556  28.06 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1171  cytochrome c, class II  26.25 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2910  cytochrome c, class II  33.76 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.963403  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0269  cytochrome c, class II  30.95 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1277  cytochrome c, class II  29.37 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2744  cytochrome c, class II  28.68 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1455  cytochrome c, class II  25.69 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0291  cytochrome c, class II  32.54 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000294803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2557  cytochrome c prime  29.73 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524451  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2544  cytochrome c, class II  29.1 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0286  cytochrome c prime  31.75 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0933227  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49090  Cytochrome C, class II  25.98 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.472535  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1989  cytochrome c, class II  24.68 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.13994  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0972  cytochrome c prime  26.83 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1614  cytochrome c, class II  26.62 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0474  cytochrome c'  31.2 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2799  cytochrome c'  25.31 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4059  putative cytochrome c-like protein  26.87 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3783  putative cytochrome c-like protein  26.87 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.550568 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2396  cytochrome c, class II  28 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00865436  normal  0.433653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3135  cytochrome c prime  27.05 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0590  cytochrome c class II  25 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2126  cytochrome c, class II  30.4 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3283  cytochrome c, class II  22.93 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00438456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0569  cytochrome c, class II  23.6 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0810  hypothetical protein  27.82 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1266  cytochrome c prime  27.61 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0242  cytochrome c, class II  35 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00183316  normal  0.94125 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4420  cytochrome c, class II  32.86 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0112  cytochrome c prime  23.02 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.277441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4122  hypothetical protein  25.2 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22167  normal  0.119493 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0327  cytochrome c, class II  27.27 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.781322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>