46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0327 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0327  cytochrome c, class II  100 
 
 		 153 aa  308  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.781322  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49090  Cytochrome C, class II  53.38 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.472535  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0107  cytochrome c prime  45.33 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3283  cytochrome c, class II  40 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00438456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0569  cytochrome c, class II  44.19 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3537  cytochrome c prime  32.24 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0147332 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2126  cytochrome c, class II  28.12 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1340  cytochrome c prime  31.08 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000194758 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4700  cytochrome c, class II  30.32 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311415  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0474  cytochrome c'  28.12 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1123  cytochrome c prime  28.03 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000239105  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2544  cytochrome c, class II  27.48 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0291  cytochrome c, class II  31.43 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000294803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0286  cytochrome c prime  31.43 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0933227  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2868  cytochrome c  27.89 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02251  cytochrome c  27.22 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1225  cytochrome c prime  27.27 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2738  cytochrome c, class II  29.01 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000239572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3420  cytochrome c'  27.48 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2396  cytochrome c, class II  28.12 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00865436  normal  0.433653 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1325  cytochrome c, class II  27.74 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1134  cytochrome c, class II  29.01 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1205  cytochrome c, class II  27.48 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000342907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1135  cytochrome c, class II  27.48 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000323618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1277  cytochrome c, class II  29.93 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1223  cytochrome c, class II  27.48 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000308946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3090  cytochrome c prime  27.48 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000689857  normal  0.0144373 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0600  cytochrome c, class II  30.2 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1300  cytochrome c prime  27.48 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000571925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0216  cytochrome c, class II  27.01 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0269  cytochrome c, class II  28.57 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1266  cytochrome c prime  27.04 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0404  cytochrome c prime  26.76 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1267  cytochrome c class II  26.72 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1062  cytochrome c class II  24.43 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.251364  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1296  Cytochrome c556-like protein  28.12 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.618676  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0474  cytochrome c, class II  27.74 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.731529  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1171  cytochrome c, class II  25 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2910  cytochrome c, class II  27.92 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.963403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2557  cytochrome c prime  30.38 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0092  hypothetical protein  36.51 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2744  cytochrome c, class II  24.84 
 
 		 149 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1106  cytochrome c, class II  22.52 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0901  cytochrome c, class II  25.78 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0462  cytochrome c'  23.49 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2799  cytochrome c'  23.45 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>