53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4420 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4420  cytochrome c, class II  100 
 
 		 154 aa  313  7e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3420  cytochrome c'  26.21 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1135  cytochrome c, class II  24.83 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000323618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1205  cytochrome c, class II  24.83 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000342907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1123  cytochrome c prime  26.81 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000239105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1134  cytochrome c, class II  24.14 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1223  cytochrome c, class II  23.45 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000308946  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0901  cytochrome c, class II  25 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1267  cytochrome c class II  23.45 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1300  cytochrome c prime  24.14 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000571925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3090  cytochrome c prime  23.45 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000689857  normal  0.0144373 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2695  cytochrome c class II  28.67 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.618119  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2738  cytochrome c, class II  24.14 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000239572  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2785  cytochrome c-554  34.92 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1785  cytochrome c prime  31.25 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.849922  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1614  cytochrome c, class II  29.31 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1427  cytochrome c, class II  34.13 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466816  normal  0.0348813 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0242  cytochrome c, class II  31.93 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00183316  normal  0.94125 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1625  cytochrome c, class II  26.28 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0590  cytochrome c class II  30.51 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0041  cytochrome c, class II  30.46 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.417622  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4700  cytochrome c, class II  31.45 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311415  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1043  cytochrome c, class II  33.62 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2557  cytochrome c prime  33.1 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524451  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4059  putative cytochrome c-like protein  33.61 
 
 		 197 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3783  putative cytochrome c-like protein  33.61 
 
 		 197 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.550568 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1075  cytochrome c, class II  24.77 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1340  cytochrome c prime  24.16 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000194758 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07030  putative cytochrome c'  29.51 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1455  cytochrome c, class II  22.5 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2023  cytochrome c prime  31.71 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1277  cytochrome c, class II  30.25 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0644  putative lipoprotein  28.69 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1440  cytochrome c, class II  24.49 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0462  cytochrome c'  23.08 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0112  cytochrome c prime  26.62 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.277441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5606  cytochrome c, class II  25.4 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.325565 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2799  cytochrome c'  23.53 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4496  cytochrome c prime  24.14 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.609438  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1296  Cytochrome c556-like protein  32.86 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.618676  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2910  cytochrome c, class II  26.79 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.963403  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0474  cytochrome c'  34.96 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0408  cytochrome c, class II  28.12 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1171  cytochrome c, class II  23.28 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1266  cytochrome c prime  23.33 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1225  cytochrome c prime  32.86 
 
 		 155 aa  43.9  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2126  cytochrome c, class II  34.15 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0972  cytochrome c prime  28.69 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2396  cytochrome c, class II  34.96 
 
 		 149 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00865436  normal  0.433653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0495  cytochrome c prime  26.21 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2229  cytochrome c, class II  27.08 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0474  cytochrome c, class II  24.51 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.731529  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0269  cytochrome c, class II  25.38 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>