56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2023 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2023  cytochrome c prime  100 
 
 		 152 aa  306  8e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3015  cytochrome c, class II  52.34 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.628177  normal  0.504757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1455  cytochrome c, class II  43.36 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5272  cytochrome c, class II  34.23 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0495  cytochrome c prime  35.62 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0901  cytochrome c, class II  32.17 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07030  putative cytochrome c'  36.22 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0644  putative lipoprotein  36.22 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4843  cytochrome c, class II  32.26 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0451  cytochrome c556-like protein  31.85 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1266  cytochrome c prime  29.73 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3420  cytochrome c'  28.28 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4970  cytochrome c', putative  31.45 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5019  cytochrome c'  30.65 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03580  cytochrome C  34.48 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0385574  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1205  cytochrome c, class II  28.28 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000342907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1135  cytochrome c, class II  28.28 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000323618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1223  cytochrome c, class II  28.28 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000308946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1075  cytochrome c, class II  29.51 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3090  cytochrome c prime  28.28 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000689857  normal  0.0144373 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0216  cytochrome c, class II  30.65 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0242  cytochrome c, class II  33.99 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00183316  normal  0.94125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0286  cytochrome c prime  33.33 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0933227  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1267  cytochrome c class II  28.28 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1300  cytochrome c prime  27.59 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000571925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1134  cytochrome c, class II  27.59 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1277  cytochrome c, class II  42.47 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3537  cytochrome c prime  26.39 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0147332 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0291  cytochrome c, class II  32.52 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000294803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2910  cytochrome c, class II  25.68 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.963403  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1171  cytochrome c, class II  25.85 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0269  cytochrome c, class II  30.71 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1340  cytochrome c prime  25.85 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000194758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1062  cytochrome c class II  27.73 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.251364  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2744  cytochrome c, class II  27.27 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0600  cytochrome c, class II  28.46 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2738  cytochrome c, class II  27.4 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000239572  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0474  cytochrome c, class II  27.59 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.731529  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0404  cytochrome c prime  29.66 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4420  cytochrome c, class II  31.71 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0408  cytochrome c, class II  29.41 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02251  cytochrome c  26.09 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0462  cytochrome c'  28.17 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2799  cytochrome c'  28.33 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2126  cytochrome c, class II  34.67 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1325  cytochrome c, class II  25.17 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0041  cytochrome c, class II  30.92 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.417622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3135  cytochrome c prime  36.36 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1225  cytochrome c prime  31.88 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1163  cytochrome c, class II  38.46 
 
 		 149 aa  43.9  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0474  cytochrome c'  33.33 
 
 		 149 aa  43.9  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0590  cytochrome c class II  24.81 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1989  cytochrome c, class II  22.5 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.13994  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49090  Cytochrome C, class II  31.17 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.472535  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1123  cytochrome c prime  32.84 
 
 		 155 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000239105  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2557  cytochrome c prime  29.51 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>