15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3783 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3783  putative cytochrome c-like protein  100 
 
 		 197 aa  393  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.550568 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4059  putative cytochrome c-like protein  100 
 
 		 197 aa  393  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9862  cytochrome C-like protein  33.67 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7163  putative cytochrome c-like protein  28.79 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.909027  normal  0.693773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0041  cytochrome c, class II  37.39 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.417622  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5857  putative cytochrome c-like protein  30 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4420  cytochrome c, class II  31.96 
 
 		 154 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1225  cytochrome c prime  26.87 
 
 		 155 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0590  cytochrome c class II  24.49 
 
 		 148 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2695  cytochrome c class II  31.25 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.618119  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0462  cytochrome c'  24.79 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3537  cytochrome c prime  30.93 
 
 		 150 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0147332 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1123  cytochrome c prime  31.5 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000239105  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1614  cytochrome c, class II  26.61 
 
 		 149 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0112  cytochrome c prime  29.46 
 
 		 144 aa  41.2  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.277441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>