61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_07030 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_07030  putative cytochrome c'  100 
 
 		 152 aa  316  9e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0644  putative lipoprotein  98.68 
 
 		 152 aa  312  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5272  cytochrome c, class II  45.33 
 
 		 149 aa  133  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0495  cytochrome c prime  45.27 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4843  cytochrome c, class II  48.12 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5019  cytochrome c'  48.51 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4970  cytochrome c', putative  47.73 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03580  cytochrome C  45.03 
 
 		 166 aa  122  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0385574  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0451  cytochrome c556-like protein  43.48 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1455  cytochrome c, class II  33.56 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2023  cytochrome c prime  35.43 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3015  cytochrome c, class II  36.09 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.628177  normal  0.504757 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0242  cytochrome c, class II  32.45 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00183316  normal  0.94125 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1340  cytochrome c prime  26.17 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000194758 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0408  cytochrome c, class II  30.83 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0269  cytochrome c, class II  29.17 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3420  cytochrome c'  26.8 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1205  cytochrome c, class II  28.03 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000342907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1135  cytochrome c, class II  28.03 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000323618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2910  cytochrome c, class II  28.33 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.963403  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1134  cytochrome c, class II  27.85 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0216  cytochrome c, class II  32.23 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3090  cytochrome c prime  26.75 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000689857  normal  0.0144373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1223  cytochrome c, class II  26.75 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000308946  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2738  cytochrome c, class II  25 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000239572  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1267  cytochrome c class II  26.75 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3135  cytochrome c prime  30.65 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0112  cytochrome c prime  28.29 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.277441 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02251  cytochrome c  24.36 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1277  cytochrome c, class II  32.23 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1300  cytochrome c prime  26.11 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000571925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1075  cytochrome c, class II  26.67 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0590  cytochrome c class II  27.34 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0286  cytochrome c prime  28.93 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0933227  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0291  cytochrome c, class II  29.91 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000294803 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0474  cytochrome c, class II  28.3 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.731529  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4420  cytochrome c, class II  29.51 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1171  cytochrome c, class II  27.2 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2695  cytochrome c class II  28.76 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.618119  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1062  cytochrome c class II  27.2 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.251364  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3537  cytochrome c prime  26.67 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0147332 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1266  cytochrome c prime  28 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1325  cytochrome c, class II  25.17 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0600  cytochrome c, class II  26.62 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0404  cytochrome c prime  28.57 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1614  cytochrome c, class II  21.48 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1785  cytochrome c prime  28.1 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.849922  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0901  cytochrome c, class II  24.8 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1989  cytochrome c, class II  23.57 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.13994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1625  cytochrome c, class II  22.76 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4700  cytochrome c, class II  26.55 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311415  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2799  cytochrome c'  21.67 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0462  cytochrome c'  24.03 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1236  cytochrome C-556  24.81 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2744  cytochrome c, class II  24.83 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5606  cytochrome c, class II  25.42 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.325565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2785  cytochrome c-554  26.23 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1427  cytochrome c, class II  26.23 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466816  normal  0.0348813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2557  cytochrome c prime  24.14 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524451  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4059  putative cytochrome c-like protein  24.1 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3783  putative cytochrome c-like protein  24.1 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.550568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>