49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0981 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  825  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  73.12 
 
 
415 aa  608  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  57.53 
 
 
421 aa  452  1e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.21972e-05  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  54.39 
 
 
412 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  56.17 
 
 
415 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  49.1 
 
 
420 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1261  major facilitator transporter  49.39 
 
 
406 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0306  major facilitator transporter  50.37 
 
 
409 aa  350  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.338859  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  27.62 
 
 
406 aa  133  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  27.91 
 
 
425 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  5.6973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  27.43 
 
 
405 aa  120  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
406 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  26.33 
 
 
415 aa  116  7e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  25.9 
 
 
406 aa  115  2e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  25.64 
 
 
406 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  25.9 
 
 
406 aa  114  4e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.04378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  26.63 
 
 
406 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  7.29069e-08 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  24.88 
 
 
407 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.23123e-10  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  26.15 
 
 
406 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  8.55622e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  26.15 
 
 
406 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  3.12687e-05 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 
420 aa  68.2  3e-10  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  23.27 
 
 
421 aa  65.1  2e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  22.76 
 
 
419 aa  63.9  5e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  23.6 
 
 
393 aa  60.5  6e-08  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  22.47 
 
 
425 aa  58.5  2e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  22.34 
 
 
447 aa  58.2  3e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  21.98 
 
 
432 aa  57.8  4e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  21.61 
 
 
432 aa  56.2  1e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  23.54 
 
 
395 aa  55.5  2e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  21.34 
 
 
432 aa  54.7  3e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  19.58 
 
 
391 aa  52  2e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  19.58 
 
 
388 aa  52.4  2e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  25.26 
 
 
326 aa  51.6  2e-05  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  21.95 
 
 
457 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  21.95 
 
 
457 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  21.95 
 
 
457 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  22.46 
 
 
420 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  32.17 
 
 
391 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  22.68 
 
 
435 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  22.71 
 
 
398 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  24.11 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  21.25 
 
 
505 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  24.37 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  24.89 
 
 
374 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  23.72 
 
 
391 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2598  major facilitator transporter  26.22 
 
 
575 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.823661  normal  0.545914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0728  General substrate transporter  25.11 
 
 
454 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 
529 aa  43.9  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  22.79 
 
 
426 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>