More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2193 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  98.93 
 
 
375 aa  756    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  100 
 
 
375 aa  764    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  44.92 
 
 
374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  41.51 
 
 
381 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  40.16 
 
 
381 aa  262  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  39.34 
 
 
374 aa  232  9e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 
371 aa  222  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
382 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  30.41 
 
 
381 aa  202  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  42.7 
 
 
351 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  32.55 
 
 
376 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  34.8 
 
 
395 aa  192  7e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
397 aa  189  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  36.86 
 
 
434 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
400 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
366 aa  186  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  34.49 
 
 
398 aa  183  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
435 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
378 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 
394 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
375 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
377 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
384 aa  176  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
431 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
384 aa  173  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
408 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
393 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
381 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
384 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 
417 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
393 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
370 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
382 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
370 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  27.2 
 
 
380 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 
420 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
381 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
437 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 
361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
370 aa  166  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
380 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  35.97 
 
 
444 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
395 aa  163  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
381 aa  162  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  32.33 
 
 
346 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
343 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
346 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
373 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
369 aa  159  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 
340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
376 aa  156  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
850 aa  155  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.69 
 
 
361 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
357 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
389 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
394 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
535 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
398 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  26.94 
 
 
375 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
381 aa  153  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
376 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
371 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
371 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  34.3 
 
 
430 aa  152  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  28.27 
 
 
372 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
381 aa  152  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
382 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  28.27 
 
 
372 aa  151  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  26.29 
 
 
373 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  25.13 
 
 
375 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
361 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 
1261 aa  149  7e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  31.02 
 
 
364 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  31.95 
 
 
355 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  36.06 
 
 
366 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  36.06 
 
 
366 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
524 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
386 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
372 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
371 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
382 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
371 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 
428 aa  144  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 
423 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
372 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
376 aa  143  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
378 aa  142  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
1089 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  30.68 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>