More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2134 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  56.52 
 
 		 721 aa  824    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2117  stage V sporulation protein D  55.6 
 
 		 739 aa  804    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  100 
 
 		 727 aa  1469    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  56.66 
 
 		 728 aa  828    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1831  stage V sporulation protein D  55.77 
 
 		 739 aa  805    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  98.62 
 
 		 727 aa  1449    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  38.25 
 
 		 719 aa  488  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  36.46 
 
 		 723 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  39.03 
 
 		 649 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  34.46 
 
 		 708 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  33.66 
 
 		 705 aa  413  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  33.57 
 
 		 695 aa  415  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.56 
 
 		 704 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  33.43 
 
 		 713 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  35.13 
 
 		 734 aa  399  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  36.55 
 
 		 646 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  33.74 
 
 		 711 aa  398  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  35.77 
 
 		 649 aa  399  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  36.61 
 
 		 644 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  35.06 
 
 		 682 aa  392  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  33.43 
 
 		 740 aa  392  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  33.76 
 
 		 708 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  35.44 
 
 		 638 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  35.6 
 
 		 638 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  35.6 
 
 		 638 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  35.6 
 
 		 638 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  35.44 
 
 		 638 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  34.73 
 
 		 638 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  35.6 
 
 		 638 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  35.44 
 
 		 638 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  35.44 
 
 		 638 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  35.44 
 
 		 638 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  35.6 
 
 		 638 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  33.23 
 
 		 645 aa  352  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 		 672 aa  334  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  36.57 
 
 		 553 aa  334  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 		 657 aa  330  7e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  30.95 
 
 		 657 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.51 
 
 		 657 aa  326  9e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.76 
 
 		 662 aa  324  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 		 654 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  30.7 
 
 		 656 aa  310  5e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  32.47 
 
 		 729 aa  306  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 		 657 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  30.58 
 
 		 660 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 		 638 aa  303  8.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 		 631 aa  300  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.04 
 
 		 689 aa  297  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2477  peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 		 651 aa  290  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.686042  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  31.84 
 
 		 653 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.76 
 
 		 702 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.21 
 
 		 582 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  30.6 
 
 		 586 aa  272  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1271  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.95 
 
 		 730 aa  268  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0816576  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 		 727 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1207  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.36 
 
 		 716 aa  261  3e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.222588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0866  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.82 
 
 		 562 aa  260  8e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.07417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.41 
 
 		 553 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.34 
 
 		 614 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.05 
 
 		 644 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  30.55 
 
 		 670 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  27.74 
 
 		 675 aa  253  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.34 
 
 		 583 aa  251  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.13 
 
 		 737 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.51 
 
 		 680 aa  249  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.15 
 
 		 680 aa  249  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2679  penicillin-binding protein  28.98 
 
 		 712 aa  248  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314189  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.29 
 
 		 692 aa  248  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.64 
 
 		 588 aa  247  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  30.09 
 
 		 673 aa  246  8e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3743  peptidoglycan glycosyltransferase  28.47 
 
 		 699 aa  246  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41017  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  30.09 
 
 		 622 aa  246  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  28.19 
 
 		 578 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.96 
 
 		 637 aa  245  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2677  penicillin-binding protein  28.67 
 
 		 712 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2634  penicillin-binding protein  28.4 
 
 		 712 aa  245  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000396671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2566  peptidoglycan glycosyltransferase  29.73 
 
 		 717 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3962  penicillin-binding protein  28.4 
 
 		 716 aa  244  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2431  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  28.71 
 
 		 712 aa  244  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00172457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  29.68 
 
 		 684 aa  244  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3767  penicillin-binding protein  28.53 
 
 		 716 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4055  penicillin-binding protein  28.53 
 
 		 716 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.32 
 
 		 655 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.06 
 
 		 673 aa  242  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2717  penicillin-binding protein  28.71 
 
 		 712 aa  242  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211599  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  29.55 
 
 		 582 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.4 
 
 		 607 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2467  penicillin-binding protein  28.57 
 
 		 712 aa  241  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00794581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3675  penicillin-binding protein  27.99 
 
 		 716 aa  241  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2648  penicillin-binding protein  28.57 
 
 		 712 aa  241  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2666  penicillin-binding protein  28.57 
 
 		 712 aa  241  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149104 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3658  penicillin-binding protein  27.99 
 
 		 716 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3931  penicillin-binding protein  28.25 
 
 		 699 aa  240  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0456911 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 		 613 aa  239  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 		 613 aa  239  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  29.91 
 
 		 839 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  28.86 
 
 		 578 aa  238  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3969  penicillin-binding protein  28.12 
 
 		 699 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00715296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4017  penicillin-binding protein  28.46 
 
 		 716 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.95 
 
 		 645 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>