81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1493 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  98.26 
 
 		 632 aa  1250    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  100 
 
 		 632 aa  1271    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  53.72 
 
 		 650 aa  653    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  28.78 
 
 		 638 aa  249  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2586  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.59 
 
 		 651 aa  245  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2534  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26.59 
 
 		 651 aa  245  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.35 
 
 		 691 aa  208  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  21.4 
 
 		 552 aa  110  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  32.41 
 
 		 364 aa  93.2  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2315  hypothetical protein  19.71 
 
 		 609 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  36.36 
 
 		 357 aa  89.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  30.07 
 
 		 371 aa  87.4  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  32.41 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  32.41 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  33.79 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  31.03 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  22.1 
 
 		 534 aa  77.8  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1602  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.09 
 
 		 737 aa  77.4  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.33 
 
 		 695 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  22.33 
 
 		 695 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  22.33 
 
 		 695 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  22.33 
 
 		 695 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.96 
 
 		 695 aa  75.5  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  22.17 
 
 		 695 aa  74.3  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  34.48 
 
 		 379 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  28.67 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  26.34 
 
 		 680 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  31.09 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  28.99 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2059  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  18.34 
 
 		 657 aa  65.1  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000771664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  19 
 
 		 631 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2789  hypothetical protein  23.68 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3465  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  18.91 
 
 		 660 aa  62.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.487354  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  27.59 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  27.87 
 
 		 369 aa  62  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3629  membrane protein  23.59 
 
 		 647 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.11 
 
 		 706 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  23.18 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.94 
 
 		 706 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  27.64 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.94 
 
 		 706 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.62 
 
 		 719 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  31.68 
 
 		 375 aa  55.5  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.62 
 
 		 708 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.11 
 
 		 746 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  24.62 
 
 		 450 aa  53.9  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  20.63 
 
 		 700 aa  53.9  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3567  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.56 
 
 		 746 aa  53.5  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.45 
 
 		 746 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1365  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.32 
 
 		 744 aa  52  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298227 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  22.01 
 
 		 725 aa  50.8  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.71 
 
 		 740 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  21.47 
 
 		 363 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  27.43 
 
 		 358 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  21.75 
 
 		 717 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.31 
 
 		 699 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36930  predicted membrane protein  18.94 
 
 		 650 aa  48.5  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0672336 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  30.15 
 
 		 372 aa  48.5  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2704  membrane protein-like protein  22.8 
 
 		 655 aa  48.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00615533  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1226  hypothetical protein  23.8 
 
 		 636 aa  47.4  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000692495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.02 
 
 		 696 aa  47.4  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  23.02 
 
 		 700 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.11 
 
 		 730 aa  47  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  23.02 
 
 		 700 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  21.75 
 
 		 717 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  21.87 
 
 		 740 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0499  membrane protein-like protein  35.71 
 
 		 695 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.02 
 
 		 696 aa  46.6  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.02 
 
 		 696 aa  46.6  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.02 
 
 		 696 aa  46.6  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.02 
 
 		 696 aa  46.6  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.86 
 
 		 696 aa  46.2  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.02 
 
 		 696 aa  46.6  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.02 
 
 		 696 aa  46.6  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.52 
 
 		 727 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  26.78 
 
 		 677 aa  45.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.98 
 
 		 727 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  25.69 
 
 		 659 aa  45.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.52 
 
 		 727 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.52 
 
 		 727 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  27.03 
 
 		 670 aa  44.3  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>