45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0517 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  692    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0290  hypothetical protein  75.76 
 
 
351 aa  441  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3199  hypothetical protein  42.57 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  36.13 
 
 
376 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  37.2 
 
 
358 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  35.48 
 
 
369 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  27.25 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  33.88 
 
 
357 aa  63.2  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  32.85 
 
 
379 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  25.45 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  24.55 
 
 
371 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  34.21 
 
 
375 aa  59.7  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2315  hypothetical protein  36.13 
 
 
609 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  37.86 
 
 
450 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  33.33 
 
 
534 aa  56.6  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  22.09 
 
 
650 aa  56.6  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  34.75 
 
 
552 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  26.37 
 
 
364 aa  54.7  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  22.77 
 
 
367 aa  52.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.64 
 
 
691 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  24.39 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  25.31 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  25.31 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  25.64 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  29.8 
 
 
758 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  24.67 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  29.14 
 
 
758 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  29.8 
 
 
758 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  29.14 
 
 
758 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  29.53 
 
 
763 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  29.8 
 
 
758 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  29.14 
 
 
758 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  29.8 
 
 
758 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.53 
 
 
763 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  28.86 
 
 
763 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  29.73 
 
 
883 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.2 
 
 
764 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  30.2 
 
 
764 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  21.59 
 
 
632 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  30.2 
 
 
764 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1602  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.49 
 
 
737 aa  43.9  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.19 
 
 
763 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  36.92 
 
 
363 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  27.03 
 
 
375 aa  42.7  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  27.52 
 
 
758 aa  42.7  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>