37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0661 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  722    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  95.29 
 
 
361 aa  698    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  99.17 
 
 
361 aa  715    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  38.95 
 
 
364 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  36.63 
 
 
367 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  35.14 
 
 
371 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  36.16 
 
 
363 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  33.71 
 
 
371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2789  hypothetical protein  35.38 
 
 
372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  31.87 
 
 
357 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  28.21 
 
 
375 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  29.28 
 
 
375 aa  144  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  25.88 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  33.14 
 
 
650 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  32.41 
 
 
632 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  32.41 
 
 
632 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  33.33 
 
 
552 aa  69.3  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  25.16 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.39 
 
 
691 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  28.38 
 
 
534 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  27.68 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.63 
 
 
706 aa  54.7  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  31.9 
 
 
367 aa  53.1  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.97 
 
 
706 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.97 
 
 
706 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.21 
 
 
696 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  28.32 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  30.36 
 
 
450 aa  50.1  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  25.31 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.53 
 
 
695 aa  46.6  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  25.35 
 
 
695 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  24.46 
 
 
695 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.35 
 
 
695 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.35 
 
 
695 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.35 
 
 
695 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  29.37 
 
 
638 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  24.8 
 
 
376 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>