52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2315 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2315  hypothetical protein  100 
 
 		 609 aa  1169    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  33.27 
 
 		 552 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  29.68 
 
 		 534 aa  108  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  21.21 
 
 		 632 aa  97.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  21.03 
 
 		 632 aa  91.7  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  34.95 
 
 		 691 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  19.89 
 
 		 650 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  36.57 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  36.77 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  40.69 
 
 		 367 aa  73.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  37.42 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  36.21 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  37.7 
 
 		 379 aa  67  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.41 
 
 		 708 aa  61.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0290  hypothetical protein  31.36 
 
 		 351 aa  57  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.55 
 
 		 746 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  30.94 
 
 		 363 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  30.56 
 
 		 371 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  44.44 
 
 		 450 aa  53.9  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2789  hypothetical protein  28.47 
 
 		 372 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  28.78 
 
 		 361 aa  53.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  30.83 
 
 		 371 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  28.26 
 
 		 367 aa  53.5  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.35 
 
 		 746 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  31.54 
 
 		 631 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  29.88 
 
 		 375 aa  50.8  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  28.06 
 
 		 361 aa  50.4  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  28.06 
 
 		 361 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  36.45 
 
 		 372 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  31.4 
 
 		 600 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3931  hypothetical protein  38.18 
 
 		 629 aa  49.3  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  29.1 
 
 		 375 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  22.67 
 
 		 717 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.21 
 
 		 706 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.21 
 
 		 706 aa  48.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  30.28 
 
 		 731 aa  47.8  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1602  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.57 
 
 		 737 aa  47.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.21 
 
 		 706 aa  47.4  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02961  hypothetical membrane protein  27.63 
 
 		 737 aa  47.4  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  23.53 
 
 		 733 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  31.82 
 
 		 376 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  30.66 
 
 		 700 aa  47  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  29.73 
 
 		 700 aa  47  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0284  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.67 
 
 		 744 aa  46.2  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  27.36 
 
 		 711 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  30.67 
 
 		 721 aa  45.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1143  hypothetical protein  36.28 
 
 		 352 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  29.61 
 
 		 711 aa  44.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  26.55 
 
 		 357 aa  44.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  28.23 
 
 		 367 aa  44.3  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  20.18 
 
 		 638 aa  44.3  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  25.27 
 
 		 758 aa  43.5  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>